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Enregistrement W4390055976 · doi:10.3389/fnimg.2023.1138193

Recalibrating single-study effect sizes using hierarchical Bayesian models

2023· article· en· W4390055976 sur OpenAlexaff
Zhipeng Cao, Matthew F. McCabe, Peter Callas, Renata B. Cupertino, Jonatan Ottino‐González, Alistair Murphy, Devarshi Pancholi, Nathan Schwab, Orr Catherine, Kent E. Hutchison, Janna Cousijn, Alain Dagher, John J. Foxe, Anna E. Goudriaan, Robert Hester, Chiang‐Shan R. Li, Wesley K. Thompson, Angelica M. Morales, Edythe D. London, Valentina Lorenzetti, Maartje Luijten, Rocío Martín‐Santos, Reza Momenan, Martin P. Paulus, Lianne Schmaal, Rajita Sinha, Nadia Solowij, Dan J. Stein, Elliot A. Stein, Anne Uhlmann, Ruth J. van Holst, Dick J. Veltman, Reínout W. Wiers, Murat Yücel, Sheng Zhang, Patricia Conrod, Scott Mackey, Hugh Garavan

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Neuroimaging · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Institutes of HealthNational Health and Medical Research CouncilNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilZonMw
Mots-clésBayesian probabilityComputer scienceEconometricsMathematicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction There are growing concerns about commonly inflated effect sizes in small neuroimaging studies, yet no study has addressed recalibrating effect size estimates for small samples. To tackle this issue, we propose a hierarchical Bayesian model to adjust the magnitude of single-study effect sizes while incorporating a tailored estimation of sampling variance. Methods We estimated the effect sizes of case-control differences on brain structural features between individuals who were dependent on alcohol, nicotine, cocaine, methamphetamine, or cannabis and non-dependent participants for 21 individual studies (Total cases: 903; Total controls: 996). Then, the study-specific effect sizes were modeled using a hierarchical Bayesian approach in which the parameters of the study-specific effect size distributions were sampled from a higher-order overarching distribution. The posterior distribution of the overarching and study-specific parameters was approximated using the Gibbs sampling method. Results The results showed shrinkage of the posterior distribution of the study-specific estimates toward the overarching estimates given the original effect sizes observed in individual studies. Differences between the original effect sizes (i.e., Cohen's d) and the point estimate of the posterior distribution ranged from 0 to 0.97. The magnitude of adjustment was negatively correlated with the sample size (r = −0.27, p < 0.001) and positively correlated with empirically estimated sampling variance (r = 0.40, p < 0.001), suggesting studies with smaller samples and larger sampling variance tended to have greater adjustments. Discussion Our findings demonstrate the utility of the hierarchical Bayesian model in recalibrating single-study effect sizes using information from similar studies. This suggests that Bayesian utilization of existing knowledge can be an effective alternative approach to improve the effect size estimation in individual studies, particularly for those with smaller samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,061
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,021
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Communication savante
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0610,021
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0020,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,575
Tête enseignante GPT0,471
Écart entre enseignants0,104 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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