Toxoplasma gondii mitochondrial association factor 1b interactome reveals novel binding partners including Ral GTPase accelerating protein α1
Notice bibliographique
Résumé
The intracellular parasite, Toxoplasma gondii , has developed sophisticated molecular strategies to subvert host processes and promote growth and survival. During infection, T. gondii replicates in a parasitophorous vacuole (PV) and modulates host functions through a network of secreted proteins. Of these, Mitochondrial Association Factor 1b (MAF1b) recruits host mitochondria to the PV, a process which confers an in vivo growth advantage, though the precise mechanisms remain enigmatic. To address this knowledge gap, we mapped the MAF1b interactome in human fibroblasts using a commercial Yeast-2-hybrid (Y2H) screen, which revealed several previously unidentified binding partners including the GAP domain of Ral GTPase Accelerating Protein α1 (RalGAPα1(GAP)). Recombinantly produced MAF1b and RalGAPα1(GAP) formed as a stable binary complex as shown by size exclusion chromatography with a K d of 334 nM as measured by isothermal titration calorimetry (ITC). Notably, no binding was detected between RalGAPα1(GAP) and the structurally conserved MAF1b homolog, MAF1a, which does not recruit host mitochondria. Next, we used hydrogen deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) to map the RalGAPα1(GAP)-MAF1b interface, which led to identification of the "GAP-binding loop" on MAF1b that was confirmed by mutagenesis and ITC to be necessary for complex formation. A high confidence Alphafold model predicts the GAP-binding loop to lie at the RalGAPα1(GAP)-MAF1b interface further supporting the HDX-MS data. Mechanistic implications of a RalGAPα1(GAP)-MAF1b complex are discussed in the context of T. gondii infection and indicates that MAF1b may have evolved multiple independent functions to increase T. gondii fitness.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».