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Enregistrement W4390070240 · doi:10.1136/bmjhci-2023-100894

Exploring the reliability of inpatient EMR algorithms for diabetes identification

2023· article· en· W4390070240 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMJ Health & Care Informatics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAlgorithmDiabetes mellitusMedicineIdentification (biology)Computer scienceMedical recordReliability (semiconductor)Data miningChartMachine learningInternal medicineStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Accurate identification of medical conditions within a real-time inpatient setting is crucial for health systems. Current inpatient comorbidity algorithms rely on integrating various sources of administrative data, but at times, there is a considerable lag in obtaining and linking these data. Our study objective was to develop electronic medical records (EMR) data-based inpatient diabetes phenotyping algorithms. Materials and methods A chart review on 3040 individuals was completed, and 583 had diabetes. We linked EMR data on these individuals to the International Classification of Disease (ICD) administrative databases. The following EMR-data-based diabetes algorithms were developed: (1) laboratory data, (2) medication data, (3) laboratory and medications data, (4) diabetes concept keywords and (5) diabetes free-text algorithm. Combined algorithms used or statements between the above algorithms. Algorithm performances were measured using chart review as a gold standard. We determined the best-performing algorithm as the one that showed the high performance of sensitivity (SN), and positive predictive value (PPV). Results The algorithms tested generally performed well: ICD-coded data, SN 0.84, specificity (SP) 0.98, PPV 0.93 and negative predictive value (NPV) 0.96; medication and laboratory algorithm, SN 0.90, SP 0.95, PPV 0.80 and NPV 0.97; all document types algorithm, SN 0.95, SP 0.98, PPV 0.94 and NPV 0.99. Discussion Free-text data-based diabetes algorithm can yield comparable or superior performance to a commonly used ICD-coded algorithm and could supplement existing methods. These types of inpatient EMR-based algorithms for case identification may become a key method for timely resource planning and care delivery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,868
Score d'incertitude au seuil0,411

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,113
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle