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Enregistrement W4390102667 · doi:10.1111/jbi.14784

Apomixis goes a long way: Genetic evidence of persistence and long‐distance seed dispersal in an ancient landscape

2023· article· en· W4390102667 sur OpenAlexfundno aff
Nicola Delnevo, Rachel M. Binks, Stephen van Leeuwen, David Coates, Shelley McArthur, Bronwyn MacDonald, Margaret Hankinson, Margaret Byrne

Notice bibliographique

RevueJournal of Biogeography · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Taxonomy and Phylogenetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRio TintoBHP
Mots-clésApomixisBiologyAsexual reproductionGenetic diversityPopulationBiological dispersalEvolutionary biologyGenetic structureLineage (genetic)EcologyGenetic variationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Aim Apomixis is a widespread trait in extreme environments worldwide, yet phylogeographical studies for species exhibiting these complex reproductive systems are still limited to temperate zones in the Northern Hemisphere. Through analyses of a combination of adult plants and seedlings, and nuclear and chloroplast DNA, we assessed the contemporary genetic outcomes of apomixis and phylogeographical patterns in an arid unglaciated landscape to understand the evolutionary trajectory of apomictic species. Location Pilbara bioregion, north‐western Australia. Taxon Senna glutinosa subsp. glutinosa . Materials and Methods Spatial patterns of genetic diversity and differentiation in three chloroplast regions and 17 nuclear microsatellite markers were evaluated in 480 plants from 20 populations of S. glutinosa subsp. glutinosa across the Pilbara bioregion. We also germinated and genotyped seed for a progeny analysis to quantify polyembryony and the relative frequency of asexual versus sexual reproduction. Results We found frequent polyembryony and a high proportion of asexual offspring (84.56%), resulting in low within‐population genotypic diversity. The nuclear dataset identified 72 multilocus lineages (MLLs) with moderate pairwise population genetic fixation and low differentiation among populations with no geographically structured genetic clustering. Chloroplast DNA showed high haplotype diversity and a widespread distribution of haplotypes. Only one peripheral population presented a single unique haplotype and MLL. Main Conclusions Analysis of this woody perennial in an arid landscape shows the influence of apomixis on genetic patterns and species persistence. Haplotype diversity was indicative of long‐term persistence within the ancient Pilbara region. Widespread distribution of haplotypes and sharing of several nuclear MLLs among distant populations indicated extensive seed dispersal throughout the study area. The combination of polyploidy, facultative apomixis and extensive seed dispersal maintains genetic variability within local populations and promotes the spread of advantageous genotypes across wide geographical distances. Therefore, apomixis, rather than an evolutionary ‘dead‐end’, can be regarded as a mechanism facilitating evolutionary success of apomictic species in extreme and complex environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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