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Enregistrement W4390148042 · doi:10.4103/jfsm.jfsm_34_22

Genetic Polymorphism and Relationship Analyses of Standard Poodle and Bichon Frise Groups Based on 19 Short Tandem Repeat Loci

2023· article· en· W4390148042 sur OpenAlexaboutno aff
Shuyan Mei, Jinlong Yang, Jianping Li, Xin Xiong, Menglei Wang, Zhichao Zhao, Yuxin Guo, Yajun Deng

Notice bibliographique

RevueJournal of Forensic Science and Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAlleleLocus (genetics)GeneticsMicrosatelliteGenetic relationshipPopulationGenetic diversityMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Context: As the increasing number of pet canines, the identification of canine has attracted much attentions in the forensic field, however, the genetic diversities of pet canines still remained unknown. Aims: To explore genetic polymorphisms of 19 short tandem repeat (STR) loci and genetic relationships between the two studied canine groups and reference group. Subjects and Methods: In the present study, genetic polymorphisms of 19 STR loci and a sex-linked zinc finger locus were analyzed in a total of 594 canines in Standard Poodle and Bichon Frise groups from China. Results: A total of 166, 159 alleles were observed in the Standard Poodle, Bichon Frise groups with the corresponding allelic frequencies ranging from 0.0030–0.6108 to 0.0012–0.6148, respectively. The combined discrimination power and probability of exclusion of 19 STR loci in Standard Poodle and Bichon Frise groups were 0.9999999999999497, 0.999962884; and 0.99999999999999995, 0.999965955, respectively. Furthermore, the genetic distances between the two canine groups and Labrador retriever group were calculated, and the results indicated that Standard Poodle and Bichon Frise groups showed a closer genetic relationship, while the two canine groups had distant genetic relationships with Labrador retriever group. The result of population genetic structure revealed that genetic component distributions in the three canine groups were different. The predicted accuracies of the constructed random forest prediction model for three validation sets (25% individuals randomly selected from three populations with 808 individuals) were higher than 0.9, especially for the individuals in validation set from the Bichon Frise group is 1. Conclusions: The 19 STR loci could be used for individual identification, canine breed identification and paternity testing in the two canine groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,624
Score d'incertitude au seuil0,577

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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