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Enregistrement W4390191580 · doi:10.1002/alz.082525

Association of novel CSF biomarker candidates with cortical thickness in genetic frontotemporal dementia

2023· article· en· W4390191580 sur OpenAlexaff
Abbe Ullgren, Sofia Bergström, Melissa Taheri Rydell, Linn Öijerstedt, Julia Remnestål, Jennie Olofsson, Harro Seelaar, John C. van Swieten, Matthis Synofzik, Raquel Sánchez‐Valle, Fermín Moreno, Elizabeth Finger, Mario Masellis, Maria Carmela Tartaglia, Rik Vandenberghe, Daniela Galimberti, Barbara Borroni, Christopher Butler, Isabelle Le Ber, Alexander Gerhard, Simon Ducharme, Robert Laforce, Jonathan D. Rohrer, Elena Rodriguez‐Vieitez, Anna Månberg, Peter Nilsson, Caroline Graff

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversité LavalMcGill UniversityUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFrontotemporal dementiaC9orf72AtrophyBiomarkerMutationDementiaPathologyBiologyMedicineGeneGeneticsDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background A novel panel of 14 proteins measured in the CSF could separate individuals with genetic frontotemporal dementia (FTD) from controls, with most significant findings observed for neurofilament medium (NEFM), neuronal pentraxin 2 (NPTX2), neurosecretory protein VGF (VGF) and aquaporin 4 (AQP4) [1]. However, it is currently unknown whether these altered protein levels in the CSF reflect neurodegenerative changes in the brain. The aim of this study was to explore the cross‐sectional associations between the previously identified CSF biomarker candidates and cortical thickness in presymptomatic and symptomatic mutation carriers, and whether those associations differ by FTD mutation type. Method We have analyzed T1 MRI scans alongside concurrent CSF samples from 202 individuals from the GENFI cohort, belonging to families that carry FTD mutations in either C9orf72, GRN or MAPT genes. The study sample included symptomatic mutation carriers, presymptomatic mutation carriers and non‐carrier controls. Cortical thickness was estimated with FreeSurfer and CSF protein levels were measured via a multiplexed antibody‐based suspension bead array. The correlations between regional cortical thickness and protein levels were calculated via linear regression. Result Altered levels of NEFM, AQP4, APOA1, PTPRN2, CTSS, SERPINA3, C4, AMPH and CD14 were all correlated with increased atrophy of at least one cortical region. Some effects were mutation specific, but NEFM, AQP4 and APOA1 correlated with atrophy in all mutation groups. We also observed mutation specific effects for 10 of the proteins. CTSS levels were only correlated with cortical atrophy in C9orf72 mutation carriers while NPTX2, VGF and PTPRN2 correlated with atrophy in GRN mutation carriers. In MAPT mutation carriers, 6 different proteins correlated with atrophy in the right temporal pole. Conclusion The proposed fluid biomarker candidates continue to show promise and further longitudinal studies will contribute to elucidate their relationship to cortical atrophy and their prognostic value in genetic FTD. [1] Bergström et al. Mol Neurodegener. 2021; 16(1):79

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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