Comparison of histological delineation of the entorhinal, perirhinal, ectorhinal, and parahippocampal cortices by different neuroanatomy laboratories
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background The medial temporal lobe (MTL) cortex, located adjacent to the hippocampus, is crucial for memory and a hotspot of neurodegenerative processes (e.g., accumulation of tau tangles or TDP‐43). Importantly, the MTL cortex comprises several subregions with distinct functional, cytoarchitectonic, and macro‐anatomical features (Fig. 1). In vivo imaging studies measuring atrophy or aggregates of pathologies in these subregions rely on various segmentation protocols. Comparability of these imaging studies is limited as segmentation protocols differ, which results from different macro‐anatomical parcellations and cytoarchitectonic definitions of MTL subregions. Thus, it must be clarified to which extent definitions of MTL subregions overlap between neuroanatomists, to establish a harmonized MTL magnetic resonance imaging (MRI) segmentation protocol. We give an overview of cytoarchitectonic definitions of MTL cortex subregions provided by four neuroanatomists from independent laboratories. Method Four neuroanatomists performed annotations of the entorhinal cortex, Brodmann area (BA) 35, BA36, and the parahippocampal cortex on digital histology images. Nissl‐stained series were acquired in three specimens (Fig. 2). Slices (50µm thick) were prepared perpendicular to the anterior commissure‐posterior comimssure line spanning the entire longitudinal extent of the MTL cortex. Neuroanatomists annotated MTL cortex subdivisions on digitized (20X resolution) slices with 5mm spacing. Parcellations, terminology, and delineations were compared between neuroanatomists. Result Cytoarchitectonic features of the MTL cortex subregions are described in detail. Overall, we observed higher agreement in the definition of the entorhinal cortex and BA35, while definitions of BA36 and the parahippocampal cortex exhibited less overlap between neuroanatomists (Fig. 2). The degree of overlap of cytoarchitectonic definitions was reflected in the neuroanatomists’ agreement on the respective delineations. Lower agreement on annotations was observed for transitional zones where gradual changes from one subregion to another occur (Fig. 3). Due to the gradual transition of features from, for example, proisocortex to periallocortex, border placement is difficult to determine according to the neuroanatomists. Conclusion The results highlight that definitions and parcellations of the MTL cortex are variable but increase understanding of why these differences arise. This sets a crucial foundation for a harmonized in vivo MRI segmentation protocol for cortical MTL subregions and the study of these regions in the context of dementia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».