Plasma based assessment of extracellular vesicles biomarkers in Alzheimer’s Disease
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Currently there are no widely accepted diagnostic tests for Alzheimer’s disease (AD). Although there is much excitement in the field of biomarker development, most proposed tests for AD are expensive, require highly specialized sample handling, invasive approaches or radiation exposure. The goal of this project was to develop non‐invasive AD biomarker assessment using nanoflow cytometry to examine proteins on circulating brain‐derived extracellular vesicles in plasma. Method Plasma samples were collected from a population of individuals clinically diagnosed with MCI and mild, moderate or severe Alzheimer’s disease and cognitively intact control subjects. Plasma was incubated with fluorescently‐conjugated antibodies against candidate biomarkers including oligomeric amyloid, fibrillar amyloid, amyloidβ‐42, pTau‐T181, pTau‐T217, pTau‐S235, Ubiquitin, Neurofilament, α‐synuclein and synaptophysin. After incubation, labelled events were quantified using the Apogee Microplus nanoflow cytometer. Using Receiver‐Operator Curve (ROC) analysis, the ability of individual markers and various combinations to distinguish diagnostic groups was determined. Result Nanoflow cytometry quantification of pTau‐T181, pTau‐T217, pTau‐S235, pTau‐T231, Aβ‐42 (among others) successfully distinguished MCI and AD plasma from healthy controls. Using ROC analysis, our most sensitive antibodies (pTau‐ T231) separate controls from AD patients with an AUC of 0.96 (Sens: 0.95/Spec: 1.0). Other prominent antibodies include pTau 181 with an AUC of 0.93 (Sens: 0.92/Spec: 0.92). The most promising combination of antibodies combines beta‐amyloid42 and pTau‐181 to separate AD patients from controls with an AUC of 0.960 (Sens: 0.93, Spec: 0.92). Isolation of EVs from plasma and validation of marker labeling was performed with Western Blot, ELISA and transmission electron microscopy. Conclusion Here we demonstrate the use of nanoflow cytometry to directly quantitate proteins on circulating extracellular vesicles in plasma from MCI and AD patients. The assays are rapid, inexpensive, directly quantitative, and require mini sample volume and manipulation. Future studies are required involving a larger population of patients who have had ‘gold standard’ biomarkers (Amyloid and tau CSF measurements), longitudinal follow‐up and/or autopsy confirmed diagnosis of AD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».