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Enregistrement W4390195953 · doi:10.1002/alz.080250

Associations between 5‐lipoxygenase activating protein (FLAP) genetic variation rs9551963 and Alzheimer’s disease phenotypes

2023· article· en· W4390195953 sur OpenAlexaff
Shiropa Noor, Daniel K Mori‐Fegan, Yuen Yan Wong, Che‐Yuan Wu, Walter Swardfager

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismMinor allele frequencyPsychologyInternal medicineAlleleOncologyCognitionAlzheimer's diseaseSNPHippocampusMedicineDiseaseGenotypeNeuroscienceGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Leukotrienes are inflammatory mediators, synthesized by 5‐lipoxygenase and its activating protein (FLAP), and their activity may play a role in Alzheimer’s disease (AD). In AD mouse models, inhibition of FLAP improved memory and reduced amyloid (Aβ) deposition. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of ALOX5AP, which encodes FLAP, have been implicated in ischemic stroke in humans. However, there is limited research on the relationship between ALOX5AP and AD. This longitudinal study investigated associations between the ALOX5AP SNP rs9551963 A/C and various AD phenotypes. Method Participants from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (phases GO, 2, and 3) diagnosed with AD, mild cognitive impairment (MCI), or clinically normal cognition (CN) were categorized as minor allele carriers (AC, CC) or non‐carriers (AA) of rs9551963. Mini Mental State Exam (MMSE) and Rey Auditory Verbal Learning Test (RAVLT) % forgetting were selected to assess cognition. Cerebrospinal fluid biomarkers and MRI brain volumetric data were also considered. Interactions between rs9551963 genotype and time (baseline, month 24, and month 48) were measured in mixed models. All models controlled for age, sex, and APOE e4 status; education and baseline intracranial volume were additional controls in cognitive and volumetric analyses respectively. Result Minor allele carriers in the AD‐MCI Aβ‐positive group had worse decline on the MMSE (F1,297 = 5.33, p = 0.022, n = 521), and smaller volumes of whole brain (F1,146 = 7.13, p = 0.008, n = 408) and hippocampus (F1,132 = 6.38, p = 0.013, n = 377) over time that were not seen in other subgroups. In the AD subgroup, Aβ‐positive carriers had greater increases in RAVLT % forgetting scores (F1,135.5 = 6.19, p = 0.014, n = 158) and greater whole brain volume loss (F1,27.6 = 5.67, p = 0.024, n = 132), over time. These associations were not seen in Aβ‐negative participants. Conclusion Minor allele carriers of the ALOX5AP SNP rs9551963 who were Aβ‐positive showed greater loss of cognitive status and memory, and more hippocampal and whole brain atrophy, over time. These findings suggest a possible effect of leukotriene synthesis in the progression of AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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