Associations between 5‐lipoxygenase activating protein (FLAP) genetic variation rs9551963 and Alzheimer’s disease phenotypes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Leukotrienes are inflammatory mediators, synthesized by 5‐lipoxygenase and its activating protein (FLAP), and their activity may play a role in Alzheimer’s disease (AD). In AD mouse models, inhibition of FLAP improved memory and reduced amyloid (Aβ) deposition. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of ALOX5AP, which encodes FLAP, have been implicated in ischemic stroke in humans. However, there is limited research on the relationship between ALOX5AP and AD. This longitudinal study investigated associations between the ALOX5AP SNP rs9551963 A/C and various AD phenotypes. Method Participants from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (phases GO, 2, and 3) diagnosed with AD, mild cognitive impairment (MCI), or clinically normal cognition (CN) were categorized as minor allele carriers (AC, CC) or non‐carriers (AA) of rs9551963. Mini Mental State Exam (MMSE) and Rey Auditory Verbal Learning Test (RAVLT) % forgetting were selected to assess cognition. Cerebrospinal fluid biomarkers and MRI brain volumetric data were also considered. Interactions between rs9551963 genotype and time (baseline, month 24, and month 48) were measured in mixed models. All models controlled for age, sex, and APOE e4 status; education and baseline intracranial volume were additional controls in cognitive and volumetric analyses respectively. Result Minor allele carriers in the AD‐MCI Aβ‐positive group had worse decline on the MMSE (F1,297 = 5.33, p = 0.022, n = 521), and smaller volumes of whole brain (F1,146 = 7.13, p = 0.008, n = 408) and hippocampus (F1,132 = 6.38, p = 0.013, n = 377) over time that were not seen in other subgroups. In the AD subgroup, Aβ‐positive carriers had greater increases in RAVLT % forgetting scores (F1,135.5 = 6.19, p = 0.014, n = 158) and greater whole brain volume loss (F1,27.6 = 5.67, p = 0.024, n = 132), over time. These associations were not seen in Aβ‐negative participants. Conclusion Minor allele carriers of the ALOX5AP SNP rs9551963 who were Aβ‐positive showed greater loss of cognitive status and memory, and more hippocampal and whole brain atrophy, over time. These findings suggest a possible effect of leukotriene synthesis in the progression of AD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».