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Enregistrement W4390199838 · doi:10.1002/alz.075039

Disordered ganglioside localization in the Alzheimer’s disease brain

2023· article· en· W4390199838 sur OpenAlexaff
Nikita Ollen‐Bittle, Hanyu Y Jiang, Shervin Pejhan, Stephen Pasternak, Shawn N. Whitehead

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensRobarts Clinical TrialsParkwood InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEntorhinal cortexNeuroscienceChemistryAlzheimer's diseaseGangliosideHuman brainPathologyHippocampusAmyloid (mycology)BiologyMedicineBiochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Alzheimer’s disease (AD) is a progressive dementia that impairs memory and cognition. Gangliosides are glycosphingolipids enriched within the central nervous system and known to alter the secondary structure of amyloid beta deposits, a hallmark of AD (Choo‐Smith et al., 1997). The ganglioside GM1 is known to exert neuroprotective properties and was proposed as a therapeutic for AD (Svennerholm, 1994). In support of this, intraventricular administration of GM1 decreased amyloid beta deposits and provided clinical benefit (Augustinsson et al., 1997). Pre‐clinical work has since demonstrated a shift from complex GM1 species to simple GM2 and GM3 is linked to neurodegenerative pathogenesis (Wang & Whitehead, 2020). However, the ganglioside GM1 also converts amyloid beta to a toxic form with beta sheet structure (Yamamoto et al., 2007), and acts as a seed for amyloid beta fibrillogenesis (Yanagisawa et al., 1995). It is possible that different GM1 subtypes may be responsible for varying affects. Understanding the profile of GM1 subtypes in the AD brain may be a key step in capitalizing on its therapeutic potential. We investigate the ratio between 18 and 20 carbon subtypes of GM1 and simple ganglioside species in post‐mortem human AD brain tissue and non‐AD controls. Brain regions interrogated include the entorhinal cortex, basal forebrain, anterior commissure and hippocampus. Method Neuroanatomical regions of interest (ROIs) were blocked from neuropathologically confirmed AD and non‐AD brains and stored in 10% formalin. Samples were prepared for matrix assisted laser desorption ionization imagining mass spectrometry (MALDI‐IMS) (Caughlin et al., 2017). MALDI‐IMS was performed in reflectron negative mode. Matching ROIs in AD and non‐AD samples (n = 5) were selected using TissueView software. Mass spectra were normalized by area under curve and peaks corresponding to gangliosides were statistically analyzed. Result Non‐AD brains demonstrated distinct d20:1/d18:1 ratios of both simple and complex gangliosides between different brain regions. This expression profile was lost in the AD brain samples. Additionally, a significant decrease in this ratio was observed in AD compared to non‐AD samples in several brain regions. Conclusion Ganglioside dysregulation and a decrease in the d20:1/d18:1 ratios in multiple brain regions are critical pathological biomarkers of AD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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