The Respiratory Microbiome in Paediatric Chronic Wet Cough: What Is Known and Future Directions
Notice bibliographique
Résumé
Chronic wet cough for longer than 4 weeks is a hallmark of chronic suppurative lung diseases (CSLD), including protracted bacterial bronchitis (PBB), and bronchiectasis in children. Severe lower respiratory infection early in life is a major risk factor of PBB and paediatric bronchiectasis. In these conditions, failure to clear an underlying endobronchial infection is hypothesised to drive ongoing inflammation and progressive tissue damage that culminates in irreversible bronchiectasis. Historically, the microbiology of paediatric chronic wet cough has been defined by culture-based studies focused on the detection and eradication of specific bacterial pathogens. Various 'omics technologies now allow for a more nuanced investigation of respiratory pathobiology and are enabling development of endotype-based models of care. Recent years have seen substantial advances in defining respiratory endotypes among adults with CSLD; however, less is understood about diseases affecting children. In this review, we explore the current understanding of the airway microbiome among children with chronic wet cough related to the PBB-bronchiectasis diagnostic continuum. We explore concepts emerging from the gut-lung axis and multi-omic studies that are expected to influence PBB and bronchiectasis endotyping efforts. We also consider how our evolving understanding of the airway microbiome is translating to new approaches in chronic wet cough diagnostics and treatments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».