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Enregistrement W4390364835 · doi:10.1016/j.cub.2023.12.068

Biosynthesis of chlorophyll c in a dinoflagellate and heterologous production in planta

2023· article· en· W4390364835 sur OpenAlexafffund
Robert E. Jinkerson, Daniel Poveda-Huertes, Elizabeth C. Cooney, Anna Cho, Rocio Ochoa‐Fernandez, Patrick J. Keeling, T. Xiang, Johan Andersen‐Ranberg

Notice bibliographique

RevueCurrent Biology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesHakai InstituteNovo Nordisk FondenGordon and Betty Moore FoundationLife Sciences Research FoundationNovo NordiskNational Science Foundation
Mots-clésPeridininBiologyDinoflagellateChlorophyllHaptophytePhotosynthesisAlgaeChlorophyll aChlorophyll cBotanyChloroplastBiochemistryChlorophyll fluorescenceFucoxanthinPhytoplanktonEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chlorophyll c is a key photosynthetic pigment that has been used historically to classify eukaryotic algae. Despite its importance in global photosynthetic productivity, the pathway for its biosynthesis has remained elusive. Here we define the CHLOROPHYLL C SYNTHASE ( CHLCS ) discovered through investigation of a dinoflagellate mutant deficient in chlorophyll c . CHLCSs are proteins with chlorophyll a / b binding and 2-oxoglutarate-Fe(II) dioxygenase (2OGD) domains found in peridinin-containing dinoflagellates; other chlorophyll c -containing algae utilize enzymes with only the 2OGD domain or an unknown synthase to produce chlorophyll c . 2OGD-containing synthases across dinoflagellate, diatom, cryptophyte, and haptophyte lineages form a monophyletic group, 8 members of which were also shown to produce chlorophyll c . Chlorophyll c 1 to c 2 ratios in marine algae are dictated in part by chlorophyll c synthases. CHLCS heterologously expressed in planta results in the accumulation of chlorophyll c 1 and c 2 , demonstrating a path to augment plant pigment composition with algal counterparts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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