MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4390444499 · doi:10.1021/acs.jcim.3c01579

Deciphering the Molecular Association of Human CRIP1a with an Agonist-Bound Cannabinoid Receptor 1

2023· article· en· W4390444499 sur OpenAlexafffund
Maya Petgrave, Shubham Devesh Ramgoolam, Aravindhan Ganesan

Notice bibliographique

RevueJournal of Chemical Information and Modeling · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCannabis and Cannabinoid Research
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCannabinoid receptorCannabinoidAgonistReceptorG protein-coupled receptorCannabinoid receptor type 2Drug discoverySignal transductionBiologyChemistryCell biologyNeuroscienceBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cannabinoid receptor 1 (CB1) is a class A G-protein-coupled receptor that plays important roles in several physiological and pathophysiological processes. Therefore, targeted regulation of CB1 activity is a potential therapeutic strategy for several diseases, including neurological disorders. Apart from cannabinoid ligands, CB1 signaling can also be regulated by different CB1-associated proteins. In particular, the cannabinoid receptor interacting protein 1a (CRIP1a) associates with an activated CB1 receptor and alters the G-protein selectivity, thereby reducing the agonist-mediated signal transduction of the CB1 receptor. Experimental evidence suggests that two peptides corresponding to the distal and central C-terminal segments of CB1 could interact with CRIP1a. However, our knowledge of the molecular basis of CB1-CRIP1a recognition is still limited. In this work, we use an extensive combination of computational methods to build the first comprehensive atomistic model human CB1-CRIP1a complex. Our model provides novel structural insights into the interactions of CRIP1a with a membrane-embedded, complete, agonist-bound CB1 receptor in humans. Our results highlight the key residues that stabilize the CB1-CRIP1a complex, which will be useful to guide in vitro mutagenesis experiments. Furthermore, our human CB1-CRIP1a complex presents a model system for structure-based drug design to target this physiologically important complex for modulating CB1 activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,493
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Chemical Information and ModelingMême sujetCannabis and Cannabinoid ResearchTravaux en français237 207