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Enregistrement W4390458072 · doi:10.1002/j.2572-9241.2019.tb00089.x

PF490 PRESENCE OF BRAFV600E MUTATION IN CHILDHOOD LCH CORRELATES WITH MULTISYSTEM DISEASE AND A POOR SURVIVAL

2019· article· en· W4390458072 sur OpenAlexaff
Prateek Bhatia, Minu Singh, Radhika Srinivasan, Nandita Kakkar, Anne Tréhan, Dipika Bansal

Notice bibliographique

RevueHemaSphere · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineSanger sequencingMutationInternal medicineRetrospective cohort studyDiseasePediatricsGastroenterologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Reports in LCH have observed BRAFV600E mutation in 35–40% cases of LCH and have demonstrated its relation with poor outcome. Aims: The aim of the study was to detect the presence of BRAFV600E mutation in children with LCH and to correlate with survival. Methods: Retrospective, Single centre, Case‐control study. Biopsy or FNAC diagnosed and immunochemistry confirmed (CD1a and S‐100 +ve) cases of LCH over 5‐years were retrieved. RQ‐PCR as well as Sanger sequencing for BRAFV600E mutation was performed. Ten cases of non‐LCH histiocytic proliferations were run as controls. Results: Thirty‐five LCH cases enrolled. 4 cases were excluded due to poor quality of DNA and 2 due to lack of follow up. The mean age was 2.5 years (0.4–11 yrs). Unisystem involvement was noted in 13/28 (46.5%) cases and multisystem in 15/28 (53.5%), including 13 with risk organ involvement. Of the 28 samples run on RQ‐PCR, BRAFV600E mutation was identified in 6/28 (21%) cases. The copy number threshold (Ct) values of positive cases ranged from 25.8–34.1 with a mean of 30.2. Sanger sequencing in all 28 samples confirmed positivity in 5/6 cases. One case did not yield reportable reads. There were no false negatives noted. Ten events (36%) were recorded, including 4 (14%) disease relapse, 3 (11%) deaths and 3 (11%) with progressive disease. All patients positive for mutation had multisystem involvement (100%) (p 0.0348), an EFS at 3‐years of 17% vs. 72% in negative group (p 0.0110) and an OS of 32.5% vs. 82% (p 0.0330). The lower BRAFV600E positivity than west could be likely due to archival samples and degraded DNA. Summary/Conclusion: The frequency for BRAFV600E positivity was low (21%), however, all positive cases had multisystem involvement and a poor 3‐year survival, confirming BRAFV600E to be a poor prognostic marker. image

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,248

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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