Deciphering the genetic architecture of anther culturability in rice using segregation distortion approach
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Anther culture is a promising technique used in rice ( Oryza sativa L.) breeding, although the genetic mechanisms associated with anther culturability remain elusive. In the process of in vitro anther culture, favorable alleles for anther culture are preferentially transmitted to doubled haploid (DH) populations, resulting in biased segregation of DH populations. Therefore, the segregation distortion (SD) method is an ideal approach for mapping the genetic loci controlling anther culturability. Performing a SD analysis using a genetic map consisting of 666 single nucleotide polymorphism markers, we identified five potential loci (logarithm of odds [LOD] > 3.5) that may be associated with anther culturability, including SDL2 and SDL3 , which are overrepresented in japonica alleles, and SDL7 , SDL9 , and SDL11 , which are overrepresented in indica alleles. In addition, nine pairs of epistatic interactions (EPIs) that contribute significantly ( p < 0.05) to SD in the DH population were identified. Among them, the interaction between SDL2 and SDL3 is particularly noteworthy. These findings suggest that anther culturability in rice is governed by complex genetic mechanisms involving multiple nuclear genes and EPIs. This study provides insights into the genetic control underlying anther culturability in rice and lays the foundation for future research aimed at identifying causal genes associated with anther culturability.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».