Signal Processing in the Retina: Interpretable Graph Classifier to Predict Ganglion Cell Responses
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
It is a popular hypothesis in neuroscience that ganglion cells in the retina are activated by selectively detecting visual features in an observed scene. While ganglion cell firings can be predicted via data-trained deep neural nets, the networks remain indecipherable, thus providing little understanding of the cells' underlying operations. To extract knowledge from the cell firings, in this paper we learn an interpretable graph-based classifier from data to predict the firings of ganglion cells in response to visual stimuli. Specifically, we learn a positive semi-definite (PSD) metric matrix <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><tex-math notation="LaTeX">${\mathbf {M}}\succeq 0$</tex-math></inline-formula> that defines Mahalanobis distances between graph nodes (visual events) endowed with pre-computed feature vectors; the computed inter-node distances lead to edge weights and a combinatorial graph that is amenable to binary classification. Mathematically, we define the objective of metric matrix <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><tex-math notation="LaTeX">${\mathbf {M}}$</tex-math></inline-formula> optimization using a graph adaptation of large margin nearest neighbor (LMNN), which is rewritten as a semi-definite programming (SDP) problem. We solve it efficiently via a fast approximation called Gershgorin disc perfect alignment (GDPA) linearization. The learned metric matrix <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><tex-math notation="LaTeX">${\mathbf {M}}$</tex-math></inline-formula> provides interpretability: important features are identified along <inline-formula xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink"><tex-math notation="LaTeX">${\mathbf {M}}$</tex-math></inline-formula>’s diagonal, and their mutual relationships are inferred from off-diagonal terms. Our fast metric learning framework can be applied to other biological systems with pre-chosen features that require interpretation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle