MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4390511336 · doi:10.1016/j.acags.2023.100149

GeoCoDA: Recognizing and validating structural processes in geochemical data. A workflow on compositional data analysis in lithogeochemistry

2024· article· en· W4390511336 sur OpenAlexaff
Eric Grunsky, Michael Greenacre, B A Kjarsgaard

Notice bibliographique

RevueApplied Computing and Geosciences · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueGeochemistry and Geologic Mapping
Établissements canadiensNatural Resources CanadaGeological Survey of CanadaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCompositional dataWorkflowGeologyGeochemistryComputer scienceData miningDatabaseMachine learning

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Geochemical data are compositional in nature and are subject to the problems typically associated with data that are restricted to the real non-negative number space with constant-sum constraint, that is, the simplex. Geochemistry can be considered a proxy for mineralogy, comprised of atomically ordered structures that define the placement and abundance of elements in the mineral lattice structure. Based on the innovative contributions of John Aitchison, who introduced the logratio transformation into compositional data analysis, this contribution provides a systematic workflow for assessing geochemical data in a simple and efficient way, such that significant geochemical (mineralogical) processes can be recognized and validated. This workflow, called GeoCoDA and presented here in the form of a tutorial, enables the recognition of processes from which models can be constructed based on the associations of elements that reflect mineralogy. Both the original compositional values and their transformation to logratios are considered. These models can reflect rock-forming processes, metamorphism, alteration and ore mineralization. Moreover, machine learning methods, both unsupervised and supervised, applied to an optimized set of subcompositions of the data, provide a systematic, accurate, efficient and defensible approach to geochemical data analysis. The workflow is illustrated on lithogeochemical data from exploration of the Star kimberlite, consisting of a series of eruptions with five recognized phases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0030,005
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied Computing and GeosciencesMême sujetGeochemistry and Geologic MappingTravaux en français237 207