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Enregistrement W4390545674 · doi:10.1038/s41597-023-02784-x

Global fine-resolution data on springtail abundance and community structure

2024· article· en· W4390545674 sur OpenAlexafffund
Anton Potapov, Ting‐Wen Chen, Anastasia V. Striuchkova, Juha M. Alatalo, Douglas Alexandre, Thomas Ashton, Frank Ashwood, А. Б. Бабенко, Ipsa Bandyopadhyaya, Carolina Riviera Duarte Maluche Baretta, Dilmar Baretta, Andrew D. Barnes, Bruno Cavalcante Bellini, Mohamed Bendjaballah, Matty P. Berg, Verónica Bernava, Stef Bokhorst, Anna Bokova, Thomas Bolger, Mathieu Bouchard, Roniere Andrade de Brito, Damayanti Buchori, Gabriela Castaño‐Meneses, Matthieu Chauvat, Mathilde Chomel, Yasuko Chow, Steven L. Chown, Aimée T. Classen, Jérôme Cortet, Peter Čuchta, Ana Manuela de la Pedrosa, Estevam Cipriano Araújo de Lima, Louis E. Deharveng, Enrique Doblas‐Miranda, Jochen Drescher, Nico Eisenhauer, Jacintha Ellers, Olga Ferlian, Susana S. D. Ferreira, Aila Soares Ferreira, Cristina Fiera, Juliane Filser, Oscar Franken, Saori Fujii, Essivi Gagnon Koudji, Meixiang Gao, Benoît Gendreau-Berthiaume, Charles Gers, Michelle Greve, Salah Hamra-Kroua, I. Tanya Handa, Motohiro Hasegawa, Charlène Heiniger, Takuo Hishi, Martin Holmstrup, Pablo Homet, Toke T. Høye, Mari Ivask, Bob Jacques, Charlene Janion‐Scheepers, Malte Jochum, Sophie Joimel, Bruna Claudia S. Jorge, Edīte Juceviča, Esther M. Kapinga, Ľubomír Kováč, Eveline J. Krab, Paul Henning Krogh, Annely Kuu, Natalya V. Kuznetsova, Weng Ngai Lam, Dunmei Lin, Zoë Lindo, Amy W. P. Liu, Jing‐Zhong Lu, María José Luciáñez Sánchez, Michael Thomas Marx, Amanda Mawan, Matthew A. McCary, Maria A. Minor, David Moreno‐Mateos, Taizo Nakamori, Ilaria Negri, Uffe N. Nielsen, Raúl Ochoa‐Hueso, Luís Carlos Iuñes de Oliveira Filho, José G. Palacios‐Vargas, Melanie M. Pollierer, Jean‐François Ponge, Mikhail Potapov, Pascal Querner, Bibishan Rai, Natália Raschmanová, Muhammad Imtiaz Rashid, Laura J. Raymond-Léonard, Aline S. dos Reis, Giles M. Ross, Laurent Rousseau, David J. Russell, Ruslan A. Saifutdinov, Sandrine Salmon, Mathieu Santonja, А. К. Сараева, Emma J. Sayer, Nicole Scheunemann, Cornelia Scholz, Julia Seeber, Peter Shaw, Yulia B. Shveenkova, Eleanor M. Slade, Sophya Stebaeva, Maria Sterzyńska, Xin Sun, Winda Ika Susanti, А. А. Таскаева, Li Si Tay, Madhav P. Thakur, Anne M. Treasure, Maria Α. Tsiafouli, Mthokozisi N. Twala, Alexei V. Uvarov, Lisa Venier, Lina A. Widenfalk, Rahayu Widyastuti, Bruna Raquel Winck, Dániel Winkler, Donghui Wu, Zhijing Xie, Rui Yin, Robson de Almeida Zampaulo, Douglas Zeppelini, Bing Zhang, Abdelmalek Zoughailech, Oliver S. Ashford, Osmar Klauberg Filho, Stefan Scheu

Notice bibliographique

RevueScientific Data · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCollembola Taxonomy and Ecology Studies
Établissements canadiensCanadian Forest ServiceWestern UniversityUniversité du Québec à MontréalUniversité du Québec en OutaouaisNatural Resources CanadaUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaDeutsches Zentrum für integrative Biodiversitätsforschung Halle-Jena-LeipzigAgencia Estatal de InvestigaciónHigher Education Commision, PakistanUniversität LeipzigRussian Science FoundationAgence Nationale pour la Gestion des Déchets RadioactifsOffice of Energy Research and DevelopmentLatvijas Zinātnes PadomeCentre National de la Recherche ScientifiqueCanadian Forest ServiceJapan Society for the Promotion of ScienceVedecká Grantová Agentúra MŠVVaŠ SR a SAVConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoMinistério da Ciência, Tecnologia e InovaçãoRussian Foundation for Basic ResearchNational Natural Science Foundation of ChinaDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Research FoundationAustrian Science FundMinisterio de Ciencia e InnovaciónEesti TeadusfondiMassey UniversityRoyal Society Te ApārangiNanyang Technological UniversityBiodiversa+U.S. Forest ServiceGovernment of AlbertaDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaCarl Tryggers Stiftelse för Vetenskaplig ForskningAlberta Environment and ParksMarsden FundBundesministerium für Bildung und ForschungUral Branch, Russian Academy of SciencesAgentúra na Podporu Výskumu a VývojaAlexander von Humboldt-StiftungKlima- und EnergiefondsSt. John's UniversityNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekRussian Academy of SciencesAgence Nationale de la RechercheMinistry of Natural ResourcesConseil Régional, Île-de-FranceAmerican Association of University WomenNational Science Foundation
Mots-clésSpringtailAbundance (ecology)EcologyGeographyDatabaseWoodlandHabitatBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Springtails (Collembola) inhabit soils from the Arctic to the Antarctic and comprise an estimated ~32% of all terrestrial arthropods on Earth. Here, we present a global, spatially-explicit database on springtail communities that includes 249,912 occurrences from 44,999 samples and 2,990 sites. These data are mainly raw sample-level records at the species level collected predominantly from private archives of the authors that were quality-controlled and taxonomically-standardised. Despite covering all continents, most of the sample-level data come from the European continent (82.5% of all samples) and represent four habitats: woodlands (57.4%), grasslands (14.0%), agrosystems (13.7%) and scrublands (9.0%). We included sampling by soil layers, and across seasons and years, representing temporal and spatial within-site variation in springtail communities. We also provided data use and sharing guidelines and R code to facilitate the use of the database by other researchers. This data paper describes a static version of the database at the publication date, but the database will be further expanded to include underrepresented regions and linked with trait data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Observationnellow
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Jeu de données
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Sans objethigh
modèles en désaccordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,009
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Les modèles divergent sur des parties de cette classification; chaque voix est préservée dans la section en fin de page.

Devis d'étudeObservationnel · Sans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique · Jeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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