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Enregistrement W4390587109 · doi:10.1093/pcp/pcad170

Transcription of the Antisense Long Non-Coding RNA, <i>SUPPRESSOR OF FEMINIZATION</i>, Represses Expression of the Female-Promoting Gene <i>FEMALE GAMETOPHYTE MYB</i> in the Liverwort <i>Marchantia polymorpha</i>

2024· article· en· W4390587109 sur OpenAlexfundno aff
Tomoaki Kajiwara, Motoki Miyazaki, Shohei Yamaoka, Yoshihiro Yoshitake, Yukiko Yasui, Ryuichi Nishihama, Takayuki Kohchi

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBryophyte Studies and Records
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyFusion Oriented REsearch for disruptive Science and TechnologyResearch Organization of Information and Systems
Mots-clésGametophyteMarchantia polymorphaBiologyMYBGeneTranscription (linguistics)SuppressorGene expressionRNAGeneticsLong non-coding RNAFeminization (sociology)Cell biologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sexual differentiation is a fundamental process in the life cycles of land plants, ensuring successful sexual reproduction and thereby contributing to species diversity and survival. In the dioicous liverwort Marchantia polymorpha, this process is governed by an autosomal sex-differentiation locus comprising FEMALE GAMETOPHYTE MYB (FGMYB), a female-promoting gene, and SUPPRESSOR OF FEMINIZATION (SUF), an antisense strand-encoded long non-coding RNA (lncRNA). SUF is specifically transcribed in male plants and suppresses the expression of FGMYB, leading to male differentiation. However, the molecular mechanisms underlying this process remain elusive. Here, we show that SUF acts through its transcription to suppress FGMYB expression. Transgene complementation analysis using CRISPR/Cas9D10A-based large-deletion mutants identified a genomic region sufficient for the sex differentiation switch function in the FGMYB-SUF locus. Inserting a transcriptional terminator sequence into the SUF-transcribed region resulted in the loss of SUF function and allowed expression of FGMYB in genetically male plants, leading to conversion of the sex phenotype from male to female. Partial deletions of SUF had no obvious impact on its function. Replacement of the FGMYB sequence with that of an unrelated gene did not affect the ability of SUF transcription to suppress sense-strand expression. Taken together, our findings suggest that the process of SUF transcription, rather than the resulting transcripts, is required for controlling sex differentiation in M. polymorpha.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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