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Enregistrement W4390589026 · doi:10.1111/vox.13584

Development of multiplexed flow cytometry‐based red blood cell antibody screen and identification assays

2024· article· en· W4390589026 sur OpenAlexaff
Robert Liwski, Anna L. Greenshields, Ian Grace, Calvino Cheng, J. G. Quinn

Notice bibliographique

RevueVox Sanguinis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryAntibodyCytometryIntracellularMolecular biologyRed blood cellWhole bloodCellBiologyImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND OBJECTIVES: The purpose of this study was to develop a high-throughput method of performing red blood cell antibody screens and identification by utilizing flow cytometry and intracellular dyes to allow a multiplexed assay where three-cell screens can be performed in a single test well and 11-cell panels in three test wells. MATERIALS AND METHODS: Reagent red blood cells were labelled using Violet Proliferation Dye 450 (V450) and Oregon Green fluorescent dyes, which bind intracellular proteins to allow up to four cells to be interrogated in a single test well. Sixteen 3-cell screen panels and ten 11-cell identification panels were tested using sera with known antibody specificity. Antibody binding was detected using secondary anti-immunoglobulin G and anti-immunoglobulin M fluorescently labelled antibodies. RESULTS: Intracellular dyes allowed clear separation of the different screen and identification panel test cells. Three distinct populations of V450+, Oregon Green+ and negative for both stains were demonstrated in the screening panel and an additional double positive for V450 and Oregon Green was utilized to include a fourth cell in the identification panel testing to increase throughput. A total of 158 screen or identification panel RBC/serum combinations were tested against different known antibodies, and expected results were obtained with 100% concordance. CONCLUSION: This study demonstrates the successful development of a high-throughput multiplexed flow cytometry-based red cell antibody screen and identification panel assays. This method could be implemented in clinical laboratories to complement existing antibody detection methods. The multiplexing enabled via intracellular staining could be utilized to further augment other flow cytometry-based transfusion assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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