Selection and Characterization of DNA Aptamers for Cytidine and Uridine
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Cytidine and uridine are two essential pyrimidine ribonucleotides, and accurate detection of these nucleosides holds significant biological importance. While many aptamers were reported to bind purines, little success was achieved for pyrimidine binding. This study employs the library‐immobilization capture‐SELEX technique to isolate aptamers capable of selectively binding to cytidine and uridine. First, a selection was performed using a mixture of cytidine and uridine as the target. This selection led to the isolation of a highly selective aptamer for cytidine with a dissociation constant ( K d ) of 0.9 μM as determined by isothermal titration calorimetry (ITC). In addition, a dual‐recognition aptamer was also discovered, which exhibited selective binding to both cytidine and uridine. Subsequently, a separate selection was carried out using uridine as the sole target, and the resulting uridine aptamer displayed a K d of 4 μM based on a thioflavin T fluorescence assay and a K d of 102 μM based on ITC. These aptamers do not have a strict requirement of metal ions for binding, and they showed excellent selectivity since no binding was observed with their nucleobases or nucleotides. This study has resulted three aptamers for pyrimidines, which can be employed in biosensors and DNA switches.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».