Transcriptomic Profiles of Pectoralis major Muscles Affected by Spaghetti Meat and Woody Breast in Broiler Chickens
Notice bibliographique
Résumé
Spaghetti meat (SM) and woody breast (WB) are breast muscle myopathies of broiler chickens, characterized by separation of myofibers and by fibrosis, respectively. This study sought to investigate the transcriptomic profiles of breast muscles affected by SM and WB. Targeted sampling was conducted on a flock to obtain 10 WB, 10 SM, and 10 Normal Pectoralis major muscle samples from 37-day-old male chickens. Total RNA was extracted, cDNA was used for pair-end sequencing, and differentially expressed genes (DEGs) were determined by a false discovery rate of <0.1 and a >1.5-fold change. Principal component and heatmap cluster analyses showed that the SM and WB samples clustered together. No DEGs were observed between SM and WB fillets, while a total of 4018 and 2323 DEGs were found when comparing SM and WB, respectively, against Normal samples. In both the SM and WB samples, Gene Ontology terms associated with extracellular environment and immune response were enriched. The KEGG analysis showed enrichment of cytokine–cytokine receptor interaction and extracellular matrix–receptor interaction pathways in both myopathies. Although SM and WB are macroscopically different, the similar transcriptomic profiles suggest that these conditions may share a common pathogenesis. This is the first study to compare the transcriptomes of SM and WB, and it showed that, while both myopathies had profiles different from the normal breast muscle, SM and WB were similar, with comparable enriched metabolic pathways and processes despite presenting markedly different macroscopic features.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».