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Enregistrement W4390616343 · doi:10.1038/s41467-023-44591-3

Radiomic tractometry reveals tract-specific imaging biomarkers in white matter

2024· article· en· W4390616343 sur OpenAlexfundno aff
Peter Neher, Dušan Hirjak, Klaus Maier‐Hein

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationF. Hoffmann-La RocheBiogenEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbDeutsches KrebsforschungszentrumBioClinicaU.S. Department of DefenseAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsNational Institute on AgingAlzheimer's Association
Mots-clésWhite matterComputational biologyMedicineMagnetic resonance imagingBiologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tract-specific microstructural analysis of the brain's white matter (WM) using diffusion MRI has been a driver for neuroscientific discovery with a wide range of applications. Tractometry enables localized tissue analysis along tracts but relies on bare summary statistics and reduces complex image information along a tract to few scalar values, and so may miss valuable information. This hampers the applicability of tractometry for predictive modelling. Radiomics is a promising method based on the analysis of numerous quantitative image features beyond what can be visually perceived, but has not yet been used for tract-specific analysis of white matter. Here we introduce radiomic tractometry (RadTract) and show that introducing rich radiomics-based feature sets into the world of tractometry enables improved predictive modelling while retaining the localization capability of tractometry. We demonstrate its value in a series of clinical populations, showcasing its performance in diagnosing disease subgroups in different datasets, as well as estimation of demographic and clinical parameters. We propose that RadTract could spark the establishment of a new generation of tract-specific imaging biomarkers with benefits for a range of applications from basic neuroscience to medical research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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