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Enregistrement W4390639526 · doi:10.1007/s10592-023-01584-5

Population structure and history of North Atlantic Blue whales (Balaenoptera musculus musculus) inferred from whole genome sequence analysis

2024· article· en· W4390639526 sur OpenAlex
Sushma Jossey, Oliver Haddrath, Lívia O. Loureiro, Jason T. Weir, Burton K. Lim, Jacqueline Miller, Stephen W. Scherer, Anders Goksøyr, Roger Lille‐Langøy, Kit M. Kovacs, Christian Lydersen, Heli Routti, Mark D. Engstrom

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueConservation Genetics · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensUniversity of TorontoThe Scarborough HospitalHospital for Sick ChildrenRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenNational Museum of Natural HistoryTechnische Universität MünchenUniversitetet i Bergen
Mots-clésBiologyBalaenopteraWhaleEndangered speciesGene flowWhalingPopulationGenetic diversityPopulation genomicsEvolutionary biologyZoologyEcologyGenomeGenomicsGenetic variationGeneticsGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Knowledge of genetic diversity and structure is essential for developing conservation strategies for endangered species. Blue whales were hunted to near extinction in the mid-twentieth century. Not-withstanding almost 380,000 animals killed globally, much remains unknown about their population structure and migration patterns. Herein, we use whole genome sequencing to elucidate the poorly understood population genetics of North Atlantic (NA) blue whales. We generated a de novo genome assembly for a NA blue whale to analyze 19 other whole genomic sequences and 31 complete mitochondrial genomes. Present-day and historical samples (earliest from 1876) from the Atlantic and Antarctic Oceans were included to understand the impact of whaling on the genetic diversity of this species. We found low but statistically significant population structuring and high genetic diversity. Demographic modeling using fastsimcoal2 rejected an absence of gene flow between eastern and western NA blue whales and suggested an asymmetric west to east gene flow. Introgression estimated using D-statistics between blue and fin whales ( Balaenoptera physalus ), was observed in all present-day samples. This gene flow was found to be unidirectional from fin whales to blue whales and accounts for ~ 3.5% of the NA blue whale’s genome. Our sequencing and population structure analyses provide a genomic baseline to inform ongoing conservation strategies for this iconic species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle