Population structure and history of North Atlantic Blue whales (Balaenoptera musculus musculus) inferred from whole genome sequence analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Knowledge of genetic diversity and structure is essential for developing conservation strategies for endangered species. Blue whales were hunted to near extinction in the mid-twentieth century. Not-withstanding almost 380,000 animals killed globally, much remains unknown about their population structure and migration patterns. Herein, we use whole genome sequencing to elucidate the poorly understood population genetics of North Atlantic (NA) blue whales. We generated a de novo genome assembly for a NA blue whale to analyze 19 other whole genomic sequences and 31 complete mitochondrial genomes. Present-day and historical samples (earliest from 1876) from the Atlantic and Antarctic Oceans were included to understand the impact of whaling on the genetic diversity of this species. We found low but statistically significant population structuring and high genetic diversity. Demographic modeling using fastsimcoal2 rejected an absence of gene flow between eastern and western NA blue whales and suggested an asymmetric west to east gene flow. Introgression estimated using D-statistics between blue and fin whales ( Balaenoptera physalus ), was observed in all present-day samples. This gene flow was found to be unidirectional from fin whales to blue whales and accounts for ~ 3.5% of the NA blue whale’s genome. Our sequencing and population structure analyses provide a genomic baseline to inform ongoing conservation strategies for this iconic species.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle