Pathogenicity assessment of Arcobacter butzleri isolated from Canadian agricultural surface water
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Water is considered a source for the transmission of Arcobacter species to both humans and animals. This study was conducted to assess the prevalence, distribution, and pathogenicity of A. butzleri strains, which can potentially pose health risks to humans and animals. Cultures were isolated from surface waters of a mixed-use but predominately agricultural watershed in eastern Ontario, Canada. The detection of antimicrobial resistance (AMR) and virulence-associated genes (VAGs), as well as enterobacterial repetitive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR) assays were performed on 913 A. butzleri strains isolated from 11 agricultural sampling sites. RESULTS: All strains were resistant to one or more antimicrobial agents, with a high rate of resistance to clindamycin (99%) and chloramphenicol (77%), followed by azithromycin (48%) and nalidixic acid (49%). However, isolates showed a significantly (p < 0.05) high rate of susceptibility to tetracycline (1%), gentamycin (2%), ciprofloxacin (4%), and erythromycin (5%). Of the eight VAGs tested, ciaB, mviN, tlyA, and pldA were detected at high frequency (> 85%) compared to irgA (25%), hecB (19%), hecA (15%), and cj1349 (12%) genes. Co-occurrence analysis showed A. butzleri strains resistant to clindamycin, chloramphenicol, nalidixic acid, and azithromycin were positive for ciaB, tlyA, mviN and pldA VAGs. ERIC-PCR fingerprint analysis revealed high genetic similarity among strains isolated from three sites, and the genotypes were significantly associated with AMR and VAGs results, which highlight their potential environmental ubiquity and potential as pathogenic. CONCLUSIONS: The study results show that agricultural activities likely contribute to the contamination of A. butzleri in surface water. The findings underscore the importance of farm management practices in controlling the potential spread of A. butzleri and its associated health risks to humans and animals through contaminated water.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».