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Enregistrement W4390687483 · doi:10.48083/ipco3495

The Role of Circulating Tumor DNA and Cell-Free DNA in the Management of Germ Cell Tumors: A Narrative Review

2023· review· en· W4390687483 sur OpenAlexvenueno aff
Isabella Dolendo, Shanice Cox, Dhruv Puri, Aditya Bagrodia

Notice bibliographique

RevueSociété Internationale d’Urologie Journal · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLiquid biopsyCell-free fetal DNABiomarkerPolymerase chain reactionBiopsyMedicineReal-time polymerase chain reactionBiologyCancer researchCancerOncologyPathologyInternal medicineGenePrenatal diagnosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Liquid biopsy has demonstrated success as a diagnostic, prognostic, and therapy response monitoring tool in various cancers and could represent a rapid and minimally invasive alternative or complementary test for testicular germ cell tumors (GCTs). This article aims to review the current state of the research into circulating tumor DNA (ctDNA) and cell-free DNA (cfDNA) in testicular GCTs.Studies have confirmed the presence of ctDNA and cfDNA can be identified in peripheral blood samples of patients with testicular GCTs. Further research has attempted to optimize the methods for ctDNA detection in plasma to improve the sensitivity of these tests; however, a single method with high sensitivity and reliability has yet to be established. Previous studies have employes different methods for detecting cfDNA, including spectrophotometry, capillary electrophoresis, quantitative polymerase chain reaction (PCR), reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), and whole genome sequencing. These studies have various elements of cfDNA examined such as total cfDNA quantity, methylation patterns, and specific mutations. Additional studies have investigated the efficacy of cfDNA detection in combination with other tests including miRNA analysis.The application of cfDNA as a biomarker has been rapidly expanding in several malignancies. However, there is a relative paucity of research on the clinical utility of cfDNA in testicular cancer, and many questions remain about the significance and feasibility of this biomarker in GCTs. Cell-free DNA shows promise as a biomarker to enhance detection and disease monitoring in testicular cancer, but robust studies are needed to develop an optimal and reproducible method for cfDNA detection in order to determine its clinical application in testicular cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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