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Enregistrement W4390697925 · doi:10.1101/2024.01.04.23299847

The Molecular Signature of Neuropathic Pain in a Human Model System

2024· preprint· en· W4390697925 sur OpenAlexafffund
Oliver Sandy-Hindmarch, Pao-Sheng Chang, Paulina S. Scheuren, Iara De Schoenmacker, Michèle Hubli, Constantinou Loizou, Stephan Wirth, Devendra Mahadevan, Akira Wiberg, Dominic Furniss, Franziska Denk, Georgios Baskozos, Annina B. Schmid

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePain Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensInternational Collaboration On Repair DiscoveriesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversität ZürichSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungUniversity of OxfordInternational Foundation for Research in ParaplegiaWellcome TrustMichael Smith Health Research BCNational Science Foundation
Mots-clésNeuromaNeuropathic painCD163NeurogenesisMedicineLesionPathologyNeuroscienceSurgeryPsychologyBiologyGeneAnesthesiaPhenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Peripheral neuropathic pain remains challenging to treat, partly due to our limited understanding of the molecular mechanisms at play in humans. In this multicentre cohort study, we describe the local molecular signature of neuropathic pain at the lesion site, using peripheral nerves of patients with Morton’s neuroma as a human model system of neuropathic pain. Plantar tibial nerves were collected from 22 patients with Morton’s neuroma (18 female, median age 60.0 [IQR 16.0] years) and control nerves from 11 participants (4 females, 58.0 [21.0] years) without a nerve injury. Pre-surgery, we collected data on pain severity, duration and nature (e.g., neuropathic pain inventory, NPSI). RNA bulk sequencing of peripheral nerves identified 3349 genes to be differentially expressed between Morton’s neuroma and controls. Gene ontology enrichment analysis and weighted gene co-expression network analyses (WGCNA) revealed modules specific for host defence and neurogenesis. Deconvolution analysis confirmed that the densities of macrophages as well as B-cells were higher in Morton’s neuroma than control samples. The findings for T-cells were inconclusive. Modules associated with defence response, neurogenesis and muscle system development correlated with paroxysmal and evoked pain in people with Morton’s neuroma. Macrophage cell populations identified by deconvolution analysis as well as single differentially expressed genes ( MARCO, CD163, STAB1; indicating the presence of a specific M(GC) subset of macrophages) correlated with paroxysmal pain. Immunofluorescent analyses confirmed the presence of demyelination, higher densities of intraneural T-cells and CD163 + MARCO + macrophage subsets in Morton’s neuroma compared to control nerves. Histological CD68 + macrophage density correlated with burning pain. Our findings provide detailed insight into the local molecular signature in the context of human focal nerve injury. There is clear evidence for an ongoing role of the immune system in chronic peripheral neuropathic pain in humans, with macrophages and specifically the M(GC) MARCO + subset implicated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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