MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4390704226 · doi:10.1093/ismeco/ycad009

Rich diversity and active spatial–temporal dynamics of<i>Thalassiosira</i>species revealed by time-series metabarcoding analysis

2024· article· en· W4390704226 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueISME Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBayEcologyBiologyAquatic ecosystemMarine ecosystemEcosystemOceanography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Thalassiosira is a species-rich genus in Bacillariophyta that not only contributes positively as primary producer, but also poses negative impacts on ecosystems by causing harmful algal blooms. Although taxonomical studies have identified a large number of Thalassiosira species, however, the composition of Thalassiosira species and their geographical distribution in marine ecosystems were not well understood due primarily to the lack of resolution of morphology-based approaches used previously in ecological expeditions. In this study, we systematically analyzed the composition and spatial–temporal dynamic distributions of Thalassiosira in the model marine ecosystem Jiaozhou Bay by applying metabarcoding analysis. Through analyzing samples collected monthly from 12 sampling sites, 14 Thalassiosira species were identified, including five species that were not previously reported in Jiaozhou Bay, demonstrating the resolution and effectiveness of metabarcoding analysis in ecological research. Many Thalassiosira species showed prominent temporal preferences in Jiaozhou Bay, with some displaying spring–winter preference represented by Thalassiosira tenera, while others displaying summer–autumn preference represented by Thalassiosira lundiana and Thalassiosira minuscula, indicating that the temperature is an important driving factor in the temporal dynamics. The application of metabarcoding analysis, equipped with appropriate molecular markers with high resolution and high specificity and databases of reference molecular marker sequences for potential all Thalassiosira species, will revolutionize ecological research of Thalassiosira species in Jiaozhou Bay and other marine ecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,434
Score d'incertitude au seuil0,552

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle