A toolbox for manipulating the genome of the major goat pathogen, Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae
Notice bibliographique
Résumé
Mycoplasma capricolum subspecies capripneumoniae ( Mccp ) is the causative agent of contagious caprine pleuropneumonia (CCPP), a devastating disease listed by the World Organisation for Animal Health (WOAH) as a notifiable disease and threatening goat production in Africa and Asia. Although a few commercial inactivated vaccines are available, they do not comply with WOAH standards and there are serious doubts regarding their efficacy. One of the limiting factors to comprehend the molecular pathogenesis of CCPP and develop improved vaccines has been the lack of tools for Mccp genome engineering. In this work, key synthetic biology techniques recently developed for closely related mycoplasmas were adapted to Mccp . CReasPy-Cloning was used to simultaneously clone and engineer the Mccp genome in yeast, prior to whole-genome transplantation into M. capricolum subsp. capricolum recipient cells. This approach was used to knock out an S41 serine protease gene recently identified as a potential virulence factor, leading to the generation of the first site-specific Mccp mutants. The Cre–lox recombination system was then applied to remove all DNA sequences added during genome engineering. Finally, the resulting unmarked S41 serine protease mutants were validated by whole-genome sequencing and their non-caseinolytic phenotype was confirmed by casein digestion assay on milk agar. The synthetic biology tools that have been successfully implemented in Mccp allow the addition and removal of genes and other genetic features for the construction of seamless targeted mutants at ease, which will pave the way for both the identification of key pathogenicity determinants of Mccp and the rational design of novel, improved vaccines for the control of CCPP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».