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Enregistrement W4390707036 · doi:10.1109/tnb.2024.3351768

An AFM-Based Model-Fitting-Free Viscoelasticity Characterization Method for Accurate Grading of Primary Prostate Tumor

2024· article· en· W4390707036 sur OpenAlexaff
Na Liu, Tianyuan Zhang, Ziheng Chen, Yue Wang, Tao Yue, Jialin Shi, Gongxin Li, Chen Yang, Haowen Jiang, Yu Sun

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on NanoBioscience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesShanghai Municipal Education CommissionNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésViscoelasticityProstate cancerProstateCharacterization (materials science)Materials scienceElastic modulusBiomedical engineeringGrading (engineering)Composite materialMedicineCancerNanotechnologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viscoelasticity is a crucial property of cells, which plays an important role in label-free cell characterization. This paper reports a model-fitting-free viscoelasticity calculation method, correcting the effects of frequency, surface adhesion and liquid resistance on AFM force-distance (FD) curves. As demonstrated by quantifying the viscosity and elastic modulus of PC-3 cells, this method shows high self-consistency and little dependence on experimental parameters such as loading frequency, and loading mode (Force-volume vs. PeakForce Tapping). The rapid calculating speed of less than 1ms per curve without the need for a model fitting process is another advantage. Furthermore, this method was utilized to characterize the viscoelastic properties of primary clinical prostate cells from 38 patients. The results demonstrate that the reported characterization method a comparable performance with the Gleason Score system in grading prostate cancer cells, This method achieves a high average accuracy of 97.6% in distinguishing low-risk prostate tumors (BPH and GS6) from higher-risk (GS7-GS10) prostate tumors and a high average accuracy of 93.3% in distinguishing BPH from prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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