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Enregistrement W4390709181 · doi:10.7554/elife.93077.1.sa2

eLife Assessment: A syngeneic spontaneous zebrafish model of tp53-deficient, EGFRviii, and PI3KCAH1047R-driven glioblastoma reveals inhibitory roles for inflammation during tumor initiation and relapse in vivo

2024· peer-review· en· W4390709181 sur OpenAlexafffund
Arezu Jahani‐Asl

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesHospital for Sick Children
Mots-clésZebrafishBiologyCancer researchTumor microenvironmentMicrogliaImmune systemInnate immune systemIn vivoMesenchymal stem cellTransplantationInflammationImmunologyCell biologyMedicineGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To build a patient-relevant in vivo model of human glioblastoma, we expressed common oncogenic variants including activated human EGFRviii and PI3KCAH1047R under the control of the radial glial-specific promoter her4.1 in syngeneic tp53 loss-of-function mutant zebrafish. Robust tumor formation was observed prior to 45 days of life, with a gene expression signature similar to human glioblastoma of the mesenchymal subtype, along with a strong inflammatory component. Within early stage tumor lesions, and in an intact and endogenous tumor microenvironment, we visualized infiltration of phagocytic cells, as well as internalization of tumor cells by mpeg1.1:GFP+ microglia/macrophages, suggesting negative regulatory pressure by pro-inflammatory cell types on tumor growth at early stages of glioblastoma initiation in vivo. Furthermore, CRISPR/Cas9-mediated gene targeting of master inflammatory transcription factors irf7 and irf8 led to increased tumor formation in the primary context, while suppression of microglial/macrophage activity led to enhanced tumor cell engraftment following transplantation into otherwise immune competent zebrafish hosts. Altogether, we developed a genetically-relevant model of aggressive human glioblastoma and harnessed the unique advantages of zebrafish including live imaging, high-throughput genetic and chemical manipulations to highlight important tumor suppressive roles for the innate immune system on glioblastoma initiation, with important future significance for therapeutic discovery and optimizations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants1,000
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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