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Enregistrement W4390745988 · doi:10.21203/rs.3.rs-3847578/v1

Pharmacokinetics and drug-likeness of anticancer phytoconstituents: ADMET, Molecular docking, and Simulation studies

2024· preprint· en· W4390745988 sur OpenAlexaff
Nootan Singh, Piyush Kumar Yadav, Juveriya Israr, Swati Vaish, Mahesh Kumar Basantani, Ajay Kumar Singh, Divya Gupta, Garima Gupta

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFerrocene Chemistry and Applications
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesMinistry of Electronics and Information technologyDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaIndian Council of Medical ResearchIndian Institute of Technology Gandhinagar
Mots-clésIn silicoGenisteinPharmacokineticsDocking (animal)DrugPharmacologyComputational biologySilibininTranscription factorChemistryBiologyBiochemistryGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<title>Abstract</title> Breast cancer (BC) is the most commonly diagnosed cancer in women around the world. Several genetic mutations tend to induce the risk of BC progression. SPDEF (Sam pointed domain containing ETS transcription factor) is a prostate-derived ETS factor that maintains homeostasis, differentiation of epithelial tissues, and heritable alterations in cancer. Plant secondary metabolites like flavonoids, terpenoids, and alkaloids have shown anticarcinogenic effect in several literatures. Therefore, in this study the SPDEF protein was used as potential breast cancer therapeutic target. Pharmacokinetic properties (ADMET), drug-likeness, and molecular docking of the fifteen phytoconstituents were assessed against SPDEF protein by various in silico approaches. The results showed that genistein, 2-hydroxychalcone, ajoene, and allicin had no toxicity. As per toxicological endpoints prediction study, the median lethal dosage (LD50) values vary from 159 to 3919 mg/Kg. All of the phytoconstituents derivatives taken into account in this investigation, are projected to be good candidates for P-glycoprotein (p-gp). Using <italic>in silico</italic> methods, the fifteen phytoconstituents identified from the different plants were predicted for their inhibitory actions against SPDEF protein, suggesting their breast cancer therapeutic potential. Silibinin, codonolactone and genistein have showed the lowest binding energy (-7.7, -6.1 and -6.1 kcal/mol) respectively and predicted to have the best inhibitory effect against SPDEF protein. We selected these three phytoconstituents for molecular dynamic simulation at 200 ns. In a comparison analysis, the Silibinin-receptor complex structure qualifies for the maximum parameters. The predictions about the pharmacokinetic properties of these phytoconstituents would form the basis for future <italic>in vivo,</italic> and <italic>in vitro</italic> experiments to identify the most appropriate therapeutic compound.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,467
Écart entre enseignants0,389 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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