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Enregistrement W4390751015 · doi:10.1038/s41390-023-02988-2

Early prediction of pediatric asthma in the Canadian Healthy Infant Longitudinal Development (CHILD) birth cohort using machine learning

2024· article· en· W4390751015 sur OpenAlexafffundabout
He Ping, Theo J. Moraes, Darlene Dai, Myrtha E. Reyna-Vargas, Ruixue Dai, Piush J. Mandhane, Elinor Simons, Meghan B. Azad, Courtney Hoskinson, Charisse Petersen, Kate L. Del Bel, Stuart E. Turvey, Padmaja Subbarao, Anna Goldenberg, Lauren Erdman

Notice bibliographique

RevuePediatric Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensVector InstituteCanadian Institute for Advanced ResearchUniversity of ManitobaUniversity of AlbertaUniversity of TorontoBC Children's HospitalUniversity of British ColumbiaHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésAsthmaMedicineAtopyPediatricsReceiver operating characteristicWheezeCohortEarly childhoodInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Early identification of children at risk of asthma can have significant clinical implications for effective intervention and treatment. This study aims to disentangle the relative timing and importance of early markers of asthma. METHODS: Using the CHILD Cohort Study, 132 variables measured in 1754 multi-ethnic children were included in the analysis for asthma prediction. Data up to 4 years of age was used in multiple machine learning models to predict physician-diagnosed asthma at age 5 years. Both predictive performance and variable importance was assessed in these models. RESULTS: Early-life data (≤1 year) has limited predictive ability for physician-diagnosed asthma at age 5 years (area under the precision-recall curve (AUPRC) < 0.35). The earliest reliable prediction of asthma is achieved at age 3 years, (area under the receiver-operator curve (AUROC) > 0.90) and (AUPRC > 0.80). Maternal asthma, antibiotic exposure, and lower respiratory tract infections remained highly predictive throughout childhood. Wheezing status and atopy are the most important predictors of early childhood asthma from among the factors included in this study. CONCLUSIONS: Childhood asthma is predictable from non-biological measurements from the age of 3 years, primarily using parental asthma and patient history of wheezing, atopy, antibiotic exposure, and lower respiratory tract infections. IMPACT: Machine learning models can predict physician-diagnosed asthma in early childhood (AUROC > 0.90 and AUPRC > 0.80) using ≥3 years of non-biological and non-genetic information, whereas prediction with the same patient information available before 1 year of age is challenging. Wheezing, atopy, antibiotic exposure, lower respiratory tract infections, and the child's mother having asthma were the strongest early markers of 5-year asthma diagnosis, suggesting an opportunity for earlier diagnosis and intervention and focused assessment of patients at risk for asthma, with an evolving risk stratification over time.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,994

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2024
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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