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Enregistrement W4390783466 · doi:10.1101/2024.01.04.574274

E protein control of NKγδT cell development through both generation and function of the stereotypic Vγ1Vδ6.3 TCR

2024· preprint· en· W4390783466 sur OpenAlexaff
Ariana Mihai, Sang-Yun Lee, Susan A. Shinton, Mitchell I. Parker, Alejandra Contreras, Baojun Zhang, Michele Rhodes, Roland L. Dunbrack, Juan Carlos Zúñiga‐Pflücker, Maria Ciofani, Yuan Zhuang, David L. Wiest

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésT-cell receptorT cellBiologyCell biologyFunction (biology)ReceptorProtein subunitMolecular biologyImmunologyImmune systemGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT T cell receptor (TCR) signals regulate important developmental transitions through induction of the E protein antagonist, Id3; however, Id3-deficiency produces paradoxical effects on γδ T cell subsets. Here, we show here that Id3-deficiency attenuates the development of Vγ3-expressing γδ T cells, while markedly enhancing the development of Vγ1Vδ6.3-expressing NKγδT cells. Id3-deficiency does so by regulating both the generation of the stereotypic Vγ1Vδ6.3 TCR expressed by NKγδT cells and its capacity to support development. Indeed, we determined that the Trav15 segment, which encodes the Vδ6.3 TCR subunit, is directly bound by E proteins that control its expression. Moreover, once expressed, the resulting Vγ1Vδ6.3 TCR in capable of specifying the innate-like NKγδT cell fate in a cell-autonomous and developmentally-unrestricted manner that is restrained by the Id3/E axis. Together, these data indicate that the paradoxical behavior of NKγδT cells in the Id3-deficient setting is entirely determined by its stereotypic Vγ1Vδ6.3 TCR complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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