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Enregistrement W4390790061 · doi:10.1002/cbin.12128

Insights into cAMP‐dependent molecular mechanisms regulating expression and function of <i>LGALS16</i> gene in choriocarcinoma JEG‐3 cells

2024· article· en· W4390790061 sur OpenAlexafffund
Jennifer D. Kaminker, Ahmad G. Butt, Hailey Killeen, Alexander V. Timoshenko

Notice bibliographique

RevueCell Biology International · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyCell biologyChoriocarcinomaCellular differentiationTrophoblastSignal transductionCell cultureDownregulation and upregulationRegulation of gene expressionGene expressionMAPK/ERK pathwayContext (archaeology)GenePlacentaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human choriocarcinoma cell line JEG-3 offers a valuable model to study galectin-16 gene (LGALS16) expression and functions in the context of placental cell differentiation and cancer cell biology. Recent evidence indicates that cAMP-mediated signaling pathways might be responsible for the upregulation of LGALS16; however, the underlying mechanisms are unknown. Here, we employed biochemical inhibitors of the cAMP cascade and CRISPR/Cas9 engineered cells to assess regulatory patterns and associations between cAMP-induced trophoblast differentiation and LGALS16 expression in JEG-3 cells. The expression of LGALS16 was significantly upregulated in parallel with human chorionic gonadotropin beta (CGB), a biomarker of syncytiotrophoblast differentiation, in response to 8-Br-cAMP. Inhibition of p38 MAPK and EPAC significantly altered LGALS16 expression during differentiation, while PKA inhibition failed to change LGALS16 and CGB3/5 expression in our cell model. The CRISPR/Cas9 LGALS16 knockout cell pool expressed a significantly lower amount of CGB3/5, a reduced level of CGB protein, and an unaltered cell growth rate in response to 8-Br-cAMP in comparison with wild-type JEG-3 cells. Collectively, these findings suggest that LGALS16 is required for the trophoblast-like differentiation of JEG-3 cells, and its expression is mediated through p38 MAPK and EPAC signaling pathway branches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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