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Enregistrement W4390824283 · doi:10.1097/ju9.0000000000000090

Reply to Editorial Comment: Microbiomes in Post-DRE Urine Samples Are Linked to Prostate Cancer Risk

2024· editorial· en· W4390824283 sur OpenAlexaff
E. David Crawford, Rick Martin, Caleb D. Phillips, Whitney Stanton, Adrie van Bokhoven, M. Scott Lucia, Paul Arangua, Francisco G. La Rosa, Zachary Grasmick, Ryan Terlecki, Margaret Meagher, Daisaku Hirano, J. Curtis Nickel, Priya N. Werahera

Notice bibliographique

RevueJU Open Plus · 2024
Typeeditorial
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcne and Rosacea Treatments and Effects
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerProstateMicrobiomeCancerUrineMedicineDiseaseInternal medicineBiologyOncologyCancer researchBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We generally agree with the editorial comment1 regarding the findings of our study.2 Many pathogens are known to infect the prostate, including bacteria and viruses such as human papillomavirus and polyomavirus. However, their exact role in prostatic diseases remains elusive due to conflicting and controversial results from a limited number of studies. The presence of C. acnes in post-DRE urine samples of patients with cancer in our study also raises further questions regarding its role in the initiation and progression of this disease. Among 9 pathogens found in one study, C. acnes genes were detected in all prostate tumor samples and all adjacent samples, but not in prostate samples from healthy individuals.3 This study included tissue samples from both western and Chinese patients. The complete absence of C. acnes in the normal tissue samples from healthy individuals and its presence not only within tumors but also in tissue samples adjacent to tumors indicate tissue adjacent to tumors may also be undergoing tumor-related changes. C. acnes has been known to induce proinflammatory cytokines4 in both macrophages and keratinocytes5,6; thus, it may pose a higher risk of prostate cancer. The editorial comment is also correct that the presence of F. magna in the control group and its relationship to chemoprevention is a hypothesis at this stage. People consuming soy daily had soy isoflavones accumulating in the prostate tissue at levels four to six times more than in serum.7 Equol is shown to express estrogenic propertieaffs and can be a potent antagonist of dihydrotestosterone. These properties can have significant implications in prevention of prostate cancer and other androgen-related malignancies.8 One confounding factor is not everyone can produce equol at metabolic levels needed for chemoprevention.9 Although the presence of microbiota that can convert soy into equol and other soy metabolites in the control group is encouraging, it is not a guarantee of protection against prostate cancer. Further research with carefully selected patient groups, appropriate controls, and a combination of gene expression and metabolomic data will be required to better understand specific roles of microorganisms in the etiology of prostate cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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