Notice bibliographique
Résumé
The need for a solution for room temperature storage of DNA is well known. Studies were conducted to assess stability of EBV DNA using Daykin Molecular Solutions GeneGuardDNA (Georgia). All laboratory testing was done at Prime Laboratories in Van Nuys California. The objective is to demonstrate sample stability of EBV DNA during shipping, storage, and multiple freeze/thaw cycles. To achieve the objectives, the study was divided into two parts; Part 1 to demonstrate stability during shipping and multiple freeze/thaw cycles. Samples were labeled as P1-1 (Positive sample 1, P1-2 first freeze/thaw, P1-3 second freeze/thaw, etc.). In Part 1 the standard deviation between positive samples ranged from 0.08 CTs to 0.25 CTs with no gradual deterioration detected with more freeze/thaw cycles). The average was 0.17 CT’s which is within the instrument’s precision range. In the past we have had no instance of repeating the same extracted sample more than two times. In Part 2 we demonstrated stability during storage. 185 archived clinical samples stored at room temperature from 2013 through 2017 were randomly chosen. DNA was extracted from these samples and EBV DNA assay testing was performed. The results from the new test were compared to the original results obtained for the samples. Concordance and p values were calculated to show the effects of long-term storage on the results of the EBV DNA assay. Pearson correlation coefficient between the original and recent assay results was 0.9564 with a p value of p<0.001 indicating statistically significant correlation between the two assay results. EBV DNA showed no deterioration of sample Ct signal was observed due to Freeze/Thaw cycles and the results were stable across multiple cycles for a period of 6 years at room temperature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,050 | 0,049 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».