Constitutive Photomorphogenesis Protein 1 homolog (COP1) sustains nuclear factor-4 alpha function in human hepatocyte models
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Constitutive Photomorphogenesis Protein 1 homolog (COP1) is a conserved E3 ligase with key roles in several biological systems. Prior work in hepatocyte derived tumors categorized COP1 as an oncogene but its role in untransformed hepatocytes remains largely unexplored. Here we have investigated the role of COP1 in primary human hepatocytes as well as in two transformed hepatocyte models, HepG2 and HuH-7 cells. Contrary to a previous report, COP1 suppression via siRNA had no noticeable impact on HepG2 and HuH-7 proliferation and was associated with contrasting rather than congruent transcriptome changes. Clustering analyses identified patterns indicative of perturbed metabolism in primary hepatocytes and HepG2 cells whereas patterns pointed to cell proliferation impacts in HuH-7 cells. In HepG2 and primary hepatocytes, COP1 suppression reduced the expression important hepatic regulators and markers, which could be restored by the introduction of a siRNA resistant COP1 transgene. COP1 downregulation reduced hepatic nuclear factor-4 alpha (HNF4A) abundance and function, as assessed by lower abundance of key HNF4A targets and reduced APOB secretion. HNF4A restoration partially rescued COP1 silencing in HepG2 cells. This study identifies COP1 as a key regulator of hepatocyte function, in part via HNF4A. COP1 was required to maintain HNF4A abundance and function in primary hepatocytes and in HepG2 cells, but not in HuH-7 cells. Lastly, by demonstrating contrasting roles of COP1 in HuH-7 and HepG2 cells, our findings also challenge previous work linking COP1 to hepatic tumorigenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».