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Enregistrement W4390876021 · doi:10.1111/jpy.13430

Taxonomy and nomenclature of <i>Oophila amblystomatis</i> (Chlorophyceae, Chlamydomonadales)

2024· article· en· W4390876021 sur OpenAlexafffund
Cory D. Bishop, David J. Garbary

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAmphibian and Reptile Biology
Établissements canadiensSt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyMonophylyCladeChlorophyceaePhylogenetic treeBotanyTaxonomy (biology)ZoologyChlamydomonasEvolutionary biologyAlgaeGeneGeneticsChlorophyta

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The unicellular green alga Oophila amblystomatis was named by Lambert in 1905 based upon its association with egg masses of the spotted salamander Ambystoma maculatum. We collected algal cells from Lambert's original egg capsule preparations that were contributed to Phycotheca Boreali-Americana (PBA) in 1905 and subjected them to DNA extraction and PCR with O. amblystomatis-specific 18S rRNA gene primers. DNA amplified from these preparations was cloned and nine clones were sequenced. Along with representative sequences from the Oophila clade and Chlorophyceae, a phylogenetic tree was inferred. Seven sequences clustered within the Oophila clade and two clustered with Chlamydomonas moewusii, which is included in a sister clade to Oophila. By sequencing algal material from the egg capsules of representative type material we can unambiguously characterize O. amblystomatis and define a monophyletic clade centered on this type material. Accordingly, we reject a recent proposal that this species be transferred to Chlorococcum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,733
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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