DNA nanostructures prevent the formation of and convert toxic amyloid proteospecies into cytocompatible and biodegradable spherical complexes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The deposition of insoluble proteinaceous aggregates in the form of amyloid fibrils within the extracellular space of tissues is associated with numerous diseases. The development of molecular approaches to arrest amyloid formation and prevent cellular degeneration remains very challenging due to the complexity of the process of protein aggregation, which encompasses an infinite array of conformations and quaternary structures. Polyanionic biopolymers, such as glycosaminoglycans and RNAs, have been shown to modulate the self‐assembly of amyloidogenic polypeptides and to reduce the toxicity induced by the formation of oligomeric and/or pre‐fibrillar proteospecies. This study evaluates the effects of double‐stranded DNA (dsDNA) nanostructures (1D, 2D, and 3D) on amyloid self‐assembly, fibril disaggregation, and the cytotoxicity associated with amyloidogenesis. Using the islet amyloid polypeptide (IAPP) whose pancreatic accumulation is the hallmark of type 2 diabetes, it was observed that dsDNA nanostructures inhibit amyloid formation by inducing the formation of spherical complexes in which the peptide adopts a random coil conformation. Interestingly, the DNA nanostructures showed a persistent ability to disassemble enzymatically and thermodynamically stable amyloid fibrils into nanoscale DNA/IAPP entities that are fully compatible with β‐pancreatic cells and are biodegradable by proteolysis. Notably, dsDNA nanostructures avidly trapped highly toxic soluble oligomeric species in complete cell culture media and converted them into non‐toxic binary complexes. Overall, these results expose the potent modulatory effects of dsDNA on amyloidogenic pathways, and these DNA nanoscaffolds could be used as a source of inspiration for the design of molecules to fight amyloid‐related disorders.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».