Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing <i>Troides aeacus</i> (Felder & Felder, 1860)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Troides aeacus , the golden birdwing (Lepidoptera, Papilionidae) is a large swallowtail butterfly widely distributed in Asia. Despite its occurrence, T. aeacus has been assigned as a major protective species in many places given the loss of their native habitats under urbanisation and anthropogenic activities. Nevertheless, the lack of its genomic resources hinders our understanding of their biology, diversity, as well as carrying out conservation measures based on genetic information or markers. Here, we report the first chromosomal-level genome assembly of T. aeacus using a combination of PacBio SMRT and Omni-C scaffolding technologies. The assembled genome (351 Mb) contains 98.94% of the sequences anchored to 30 pseudo-molecules. The genome assembly also has high sequence continuity with scaffold length N50 = 12.2 Mb. A total of 28,749 protein-coding genes were predicted, and high BUSCO score completeness (98.9% of BUSCO metazoa_odb10 genes) was also revealed. This high-quality genome offers a new and significant resource for understanding the swallowtail butterfly biology, as well as carrying out conservation measures of this ecologically important lepidopteran species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».