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Enregistrement W4390904977 · doi:10.1162/imag_a_00081

Methods for decoding cortical gradients of functional connectivity

2024· article· en· W4390904977 sur OpenAlexaff
Julio A. Peraza, Taylor Salo, Michael C. Riedel, Katherine L. Bottenhorn, Jean‐Baptiste Poline, Jérôme Dockès, James D. Kent, Jessica E. Bartley, Jessica S. Flannery, Lauren D. Hill-Bowen, Rosario Pintos Lobo, Ranjita Poudel, Kimberly L. Ray, Jennifer L. Robinson, Robert W. Laird, Matthew T. Sutherland, Alejandro de la Vega, Angela R. Laird

Notice bibliographique

RevueImaging Neuroscience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institutes of Health
Mots-clésDecoding methodsComputer scienceLeverage (statistics)Functional connectivityArtificial intelligenceSegmentationPattern recognition (psychology)PsychologyNeuroscienceAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Macroscale gradients have emerged as a central principle for understanding functional brain organization. Previous studies have demonstrated that a principal gradient of connectivity in the human brain exists, with unimodal primary sensorimotor regions situated at one end and transmodal regions associated with the default mode network and representative of abstract functioning at the other. The functional significance and interpretation of macroscale gradients remains a central topic of discussion in the neuroimaging community, with some studies demonstrating that gradients may be described using meta-analytic functional decoding techniques. However, additional methodological development is necessary to fully leverage available meta-analytic methods and resources and quantitatively evaluate their relative performance. Here, we conducted a comprehensive series of analyses to investigate and improve the framework of data-driven, meta-analytic methods, thereby establishing a principled approach for gradient segmentation and functional decoding. We found that a two-segment solution determined by a k-means segmentation approach and an LDA-based meta-analysis combined with the NeuroQuery database was the optimal combination of methods for decoding functional connectivity gradients. Finally, we proposed a method for decoding additional components of the gradient decomposition. The current work aims to provide recommendations on best practices and flexible methods for gradient-based functional decoding of fMRI data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,047
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,143
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,250

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0470,143
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,009
Bibliométrie0,0090,008
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,392
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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