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Enregistrement W4390907256 · doi:10.1101/2024.01.13.24301174

Unveiling the crucial neuronal role of the proteasomal ATPase subunit gene <i>PSMC5</i> in neurodevelopmental proteasomopathies

2024· preprint· en· W4390907256 sur OpenAlexaff
Sébastien Küry, Janelle E. Stanton, Geeske M. van Woerden, Tzung‐Chien Hsieh, Cory Rosenfelt, Marie‐Pier Scott‐Boyer, Victoria Most, Tianyun Wang, Jonas Johannes Papendorf, Charlotte de Konink, Wallid Deb, Virginie Vignard, Maja Studencka‐Turski, Thomas Besnard, Anna Marta Hajdukowicz, Franziska G. Thiel, Sophie Möller, Laëtitia Florenceau, Silvestre Cuinat, Sylvain Marsac, Ingrid M. Wentzensen, Annabelle Tuttle, Cara Forster, Johanna Striesow, Richard Golnik, Damara Ortiz, Laura Jenkins, Jill A. Rosenfeld, Alban Ziegler, Clara Houdayer, Dominique Bonneau, Erin Torti, Amber Begtrup, Kristin G. Monaghan, Sureni V. Mullegama, Catharina M.L. Volker‐Touw, Koen L.I. van Gassen, Renske Oegema, Mirjam de Pagter, Katharina Steindl, Anita Rauch, Ivan Ivanovski, Kimberly S. McDonald, Emily Boothe, Andrew Dauber, Janice Baker, Noelle Andrea V. Fabie, Raphael Bernier, Tychele N. Turner, Siddharth Srivastava, Kira A. Dies, Lindsay C. Swanson, Carrie Costin, Rebekah Jobling, John Pappas, Rachel Rabin, Dmitriy Niyazov, Anne Chun‐Hui Tsai, Karen Kovak, David B. Beck, MCV Malicdan, David R. Adams, Lynne A. Wolfe, Rebecca Ganetzky, Colleen Muraresku, Davit Babikyan, Zdeněk Sedláček, Miroslava Hančárová, Andrew T. Timberlake, Hind Al Saif, Berkley Nestler, Kayla King, M.J. Hajianpour, Gregory Costain, D’Arcy Prendergast, Chumei Li, David Geneviève, Antonio Vitobello, Arthur Sorlin, Christophe Philippe, Tamar Harel, Ori Toker, Ataf Sabir, Derek Lim, Mark Hamilton, Lisa Bryson, Elaine Cleary, Sacha Weber, Trevor L. Hoffman, Anna M. Cueto‐González, Eduardo F. Tizzano, David Gómez‐Andrés, Marta Codina‐Solà, Athina Ververi, Efterpi Pavlidou, Alexandros Lambropoulos, Kyriakos Garganis, Marlène Rio, Jonathan Lévy, Sarah Jurgensmeyer, Anne McRae, Mathieu Lessard, Daniela D’Agostino, Isabelle De Bie, Meret Wegler, Rami Abou Jamra, Susanne B. Kamphausen, Viktoria Bothe, Larissa M. Busch, Uwe Völker, Elke Hammer, Kristian Wende, Benjamin Cogné, Bertrand Isidor, Jens Meiler, Amélie Bosc-Rosati, Julien Marcoux, Marie‐Pierre Bousquet, Jérémie Poschmann, Frédéric Laumonnier, Peter W. Hildebrand, Evan E. Eichler, Kirsty McWalter, Peter Krawitz, Arnaud Droit, Ype Elgersma, Andreas M. Grabrucker, François V. Bolduc, Stéphane Bezieau, Frédéric Ebstein, Elke Krüger

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteMcGill UniversitySickKids FoundationUniversity of TorontoMcMaster University Medical CentreHospital for Sick ChildrenUniversity of AlbertaUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésProteasomeBiologyHippocampal formationGene knockdownProtein subunitNeurodevelopmental disorderNeuroscienceCell biologyUbiquitinPhenotypeKinaseGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Neurodevelopmental proteasomopathies represent a distinctive category of neurodevelopmental disorders (NDD) characterized by genetic variations within the 26S proteasome, a protein complex governing eukaryotic cellular protein homeostasis. In our comprehensive study, we identified 23 unique variants in PSMC5 , which encodes the AAA-ATPase proteasome subunit PSMC5/Rpt6, causing syndromic NDD in 38 unrelated individuals. Overexpression of PSMC5 variants altered human hippocampal neuron morphology, while PSMC5 knockdown led to impaired reversal learning in flies and loss of excitatory synapses in rat hippocampal neurons. PSMC5 loss-of-function resulted in abnormal protein aggregation, profoundly impacting innate immune signaling, mitophagy rates, and lipid metabolism in affected individuals. Importantly, targeting key components of the integrated stress response, such as PKR and GCN2 kinases, ameliorated immune dysregulations in cells from affected individuals. These findings significantly advance our understanding of the molecular mechanisms underlying neurodevelopmental proteasomopathies, provide links to research in neurodegenerative diseases, and open up potential therapeutic avenues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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