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Enregistrement W4390915393 · doi:10.1158/1538-7445.panca2023-a094

Abstract A094: LIN28B/HMGA2 axis accelerates PDA by promoting oncogenic protein synthesis

2024· article· en· W4390915393 sur OpenAlexaff
Stephanie Dobersch, Sarah Cavendar, Naomi Yamamoto, Liberales Debraj Boila, Cindy L. Wladyka, Martine P. Roudier, Faiyaz Notta, Robert N. Eisenman, Andrew C. Hsieh, Sita Kugel

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHMGA2KRASBiologyCancer researchPancreatic cancerCancerCell biologyGeneticsMutationGenemicroRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDA) is one of the most lethal human malignancies and is projected to be the second leading cause of cancer deaths in the United States by 2030. Molecular characterization studies have described two major transcriptional subsets, called 'classical’ and ‘basal’. Basal PDAs (~25% of PDAs) have the worst overall survival and are the only class to act as an independent poor prognostic factor. The imminent entry of KRAS inhibitors into the clinic to treat PDA is poised to change this, but genetic experiments have predicted that the basal subtype of pancreatic cancer will be intrinsically resistant to these inhibitors. Therefore, there is an urgent need to understand basal PDA development and identify its unique vulnerabilities. We have discovered that the expression of the oncofetal RNA-binding protein LIN28B and its downstream target, the chromatin protein and high-mobility group (HMG) AT-hook 2 (HMGA2), are highly expressed in the basal subtype of PDA. We find LIN28B dramatically accelerates KRAS-driven PDA and acts as a potent oncogene in genetically engineered mouse models (GEMMs) of PDA. We find that HMGA2, downstream of LIN28B, controls cell growth and orchestrates the pathogenesis of basal PDA by hijacking a precise node of mRNA translation machinery. This raises the intriguing possibility that the aberrant activation of HMGA2 increases mRNA translation and may be one mechanism by which PDA attains the highly aggressive basal phenotype. Mechanistically, we observed that loss of HMGA2 results in decreased phosphorylation of S6K and EIF4B. Interestingly, this was independent of changes in MTOR activity. Loss of function studies using siRNA or inhibitors against PP2A restored pS6K and pEIF4B levels, and mRNA translation when HMGA2 was lost. It is known that reduction in pEIF4B levels leads to a reduction in mRNA translation of difficult-to-transcribe transcripts, such as the MYC oncogene. Indeed, loss of HMGA2 leads to a dramatic reduction in MYC protein levels but no changes to transcription or protein stability. Thus, our work has unveiled a new axis in LIN28B/HMGA2 high basal PDA that controls mRNA translation independent of MTOR, is reliant on PP2A, and controls cell growth through MYC translation. This work has the potential to identify innovative therapeutic strategies to combat this deadly subtype of PDA. Citation Format: Stephanie Dobersch, Sarah Cavendar, Naomi Yamamoto, Liberales Debraj Boila, Cindy Wladyka, Martine Roudier, Faiyaz Notta, Robert Eisenman, Andrew Hsieh, Sita Kugel. LIN28B/HMGA2 axis accelerates PDA by promoting oncogenic protein synthesis [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Pancreatic Cancer; 2023 Sep 27-30; Boston, Massachusetts. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2024;84(2 Suppl):Abstract nr A094.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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