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Enregistrement W4390928581 · doi:10.1186/s13244-023-01572-w

METhodological RadiomICs Score (METRICS): a quality scoring tool for radiomics research endorsed by EuSoMII

2024· article· en· W4390928581 sur OpenAlexaff
Burak Koçak, Tugba Akinci D’Antonoli, Nathaniel D. Mercaldo, Ángel Alberich‐Bayarri, Bettina Baeßler, Ilaria Ambrosini, Anna Andreychenko, Spyridon Bakas, Regina G. H. Beets‐Tan, Keno K. Bressem, Irène Buvat, Roberto Cannella, L.A. Cappellini, Armando Ugo Cavallo, Leonid Chepelev, Linda C. Chu, Aydın Demircioğlu, Nandita M. deSouza, Matthias Dietzel, Salvatore Claudio Fanni, Andriy Fedorov, Laure Fournier, Valentina Giannini, Rossano Girometti, Kevin B. W. Groot Lipman, Georgios Kalarakis, Brendan S. Kelly, Michail E. Klontzas, Dow‐Mu Koh, Elmar Kotter, Ho Yun Lee, Mario Maas, Luis Martí‐Bonmatí, Henning Müller, Nancy A. Obuchowski, Fanny Orlhac, Nickolas Papanikolaou, EA Petrash, Elisabeth Pfaehler, Daniel Pinto dos Santos, Andrea Ponsiglione, S. Sabater, Francesco Sardanelli, Philipp Seeböck, Nanna M. Sijtsema, Arnaldo Stanzione, Alberto Traverso, Lorenzo Ugga, Martin Vallières, Lisanne V. van Dijk, Joost J. M. van Griethuysen, Robbert W. van Hamersvelt, Peter M. A. van Ooijen, Federica Vernuccio, Alan Wang, Stuart Williams, Jan Witowski, Zhongyi Zhang, Alex Zwanenburg, Renato Cuocolo

Notice bibliographique

RevueInsights into Imaging · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire de SherbrookeUniversité de SherbrookeUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésRadiomicsMedicineNeuroradiologyMedical physicsQuality ScoreQuality (philosophy)Interventional radiologyRadiologyNeurologyOperations managementEngineeringMetric (unit)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To propose a new quality scoring tool, METhodological RadiomICs Score (METRICS), to assess and improve research quality of radiomics studies. METHODS: We conducted an online modified Delphi study with a group of international experts. It was performed in three consecutive stages: Stage#1, item preparation; Stage#2, panel discussion among EuSoMII Auditing Group members to identify the items to be voted; and Stage#3, four rounds of the modified Delphi exercise by panelists to determine the items eligible for the METRICS and their weights. The consensus threshold was 75%. Based on the median ranks derived from expert panel opinion and their rank-sum based conversion to importance scores, the category and item weights were calculated. RESULT: In total, 59 panelists from 19 countries participated in selection and ranking of the items and categories. Final METRICS tool included 30 items within 9 categories. According to their weights, the categories were in descending order of importance: study design, imaging data, image processing and feature extraction, metrics and comparison, testing, feature processing, preparation for modeling, segmentation, and open science. A web application and a repository were developed to streamline the calculation of the METRICS score and to collect feedback from the radiomics community. CONCLUSION: In this work, we developed a scoring tool for assessing the methodological quality of the radiomics research, with a large international panel and a modified Delphi protocol. With its conditional format to cover methodological variations, it provides a well-constructed framework for the key methodological concepts to assess the quality of radiomic research papers. CRITICAL RELEVANCE STATEMENT: A quality assessment tool, METhodological RadiomICs Score (METRICS), is made available by a large group of international domain experts, with transparent methodology, aiming at evaluating and improving research quality in radiomics and machine learning. KEY POINTS: • A methodological scoring tool, METRICS, was developed for assessing the quality of radiomics research, with a large international expert panel and a modified Delphi protocol. • The proposed scoring tool presents expert opinion-based importance weights of categories and items with a transparent methodology for the first time. • METRICS accounts for varying use cases, from handcrafted radiomics to entirely deep learning-based pipelines. • A web application has been developed to help with the calculation of the METRICS score ( https://metricsscore.github.io/metrics/METRICS.html ) and a repository created to collect feedback from the radiomics community ( https://github.com/metricsscore/metrics ).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,272
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,348
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,728
Score d'incertitude au seuil0,898

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2720,348
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,004
Bibliométrie0,0210,012
Études des sciences et des technologies0,0030,005
Communication savante0,0070,006
Science ouverte0,0030,013
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,204
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations269
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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