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Enregistrement W4390937369 · doi:10.1016/j.omtm.2024.101190

Extracellular vesicle depletion and UGCG overexpression mitigate the cell density effect in HEK293 cell culture transfection

2024· article· en· W4390937369 sur OpenAlexfundno aff
Pol Pérez‐Rubio, Jesús Lavado‐García, Laia Bosch-Molist, Elianet Lorenzo, Laura Cervera, Francesc Gòdia

Notice bibliographique

RevueMolecular Therapy — Methods & Clinical Development · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNovo Nordisk FondenGeneralitat de CatalunyaMcGill UniversityCentro Nacional de Investigaciones CardiovascularesMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesUniversitat Autònoma de BarcelonaMinisterio de Ciencia e Innovación
Mots-clésTransfectionHEK 293 cellsExtracellular vesiclesCell biologyExtracellularExtracellular vesicleCell cultureCellChemistryVesicleMolecular biologyMicrovesiclesBiologyGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hitherto unexplained reduction of cell-specific productivity in transient gene expression (TGE) at high cell density (HCD) is known as the cell density effect (CDE). It currently represents a major challenge in TGE-based bioprocess intensification. This phenomenon has been largely reported, but the molecular principles governing it are still unclear. The CDE is currently understood to be caused by the combination of an unknown inhibitory compound in the extracellular medium and an uncharacterized cellular change at HCD. This study investigates the role of extracellular vesicles (EVs) as extracellular inhibitors for transfection through the production of HIV-1 Gag virus-like particles (VLPs) via transient transfection in HEK293 cells. EV depletion from the extracellular medium restored transfection efficiency in conditions that suffer from the CDE, also enhancing VLP budding and improving production by 60%. Moreover, an alteration in endosomal formation was observed at HCD, sequestering polyplexes and preventing transfection. Overexpression of UDP-glucose ceramide glucosyltransferase (UGCG) enzyme removed intracellular polyplex sequestration, improving transfection efficiency. Combining EV depletion and UGCG overexpression improved transfection efficiency by ∼45% at 12 × 10 6 cells/mL. These results suggest that the interaction between polyplexes and extracellular and intracellular vesicles plays a crucial role in the CDE, providing insights for the development of strategies to mitigate its impact.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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