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Enregistrement W4391090641 · doi:10.1101/2024.01.21.24301546

Development of a Seizure Matching System for Clinical Decision Making in Epilepsy Surgery

2024· preprint· en· W4391090641 sur OpenAlexafffund
John Thomas, Chifaou Abdallah, Kassem Jaber, Olivier Aron, Irena Doležalová, Vadym Gnatkovsky, Daniel Mansilla, Päivi Nevalainen, Raluca Pana, Stephan Schuele, Jaysingh Singh, Ana Suller Martí, Alexandra Urban, Jeffery A. Hall, François Dubeau, Jean Gotman, Birgit Frauscher

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensWestern UniversityMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMontreal Neurological Institute and Hospital
Mots-clésStereoelectroencephalographySimilarity (geometry)EpilepsyElectroencephalographyMatching (statistics)Epilepsy surgeryArtificial intelligenceComputer scienceCorrelationPsychologyPattern recognition (psychology)MedicineNeuroscienceMathematicsPathologyImage (mathematics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background and Objectives The proportion of patients becoming seizure-free after epilepsy surgery has stagnated. Large multi-center stereo-electroencephalography datasets can potentially allow comparing a new patient to past similar cases and make clinical decisions with the knowledge of how similar cases were treated in the past. However, the complexity of these evaluations makes the manual search for similar patients in a large database impractical. We aim to develop an automated system that electrographically and anatomically matches seizures from a patient to those in a database. In addition, since we do not know what features define seizure similarity, particularly considering the various stereo-electroencephalography implantation schemes, we evaluate the agreement and features among experts in classifying seizure similarity. Methods We utilized SEEG seizures from consecutive patients who underwent stereo-electroencephalography for epilepsy surgery. Eight international experts evaluated seizure-pair similarity using a four-level similarity score through a graphical user interface. As our primary outcome, we developed and validated an automated seizure matching system by employing a leave-one-expert-out approach. Secondary outcomes included the inter-rater agreement and features for classifying seizure similarity. Results 320 SEEG seizures from 95 patients were utilized. The seizure matching system achieved an area-under-the-curve of 0.82 (95% CI, 0.819-0.822), indicating its feasibility. Six distinct seizure similarity features were identified and proved effective: onset region, onset pattern, propagation region, duration, extent of spread, and propagation speed. Among these features, the onset region showed the strongest correlation with expert scores (Spearman’s rho=0.75, p <0.001). Additionally, the moderate inter-rater agreement confirmed the practicality of our approach: for the four-level classification, median agreement was 73.9% (interquartile range, 7%), and beyond-chance Gwet’s kappa was 0.45 (0.16); for the binary classification of similar vs. not related, agreement stood at 71.9% (4.7%) with a kappa of 0.46 (0.13). Discussion We demonstrate the feasibility and validity of a stereo-electroencephalography seizure matching system across patients, effectively mirroring the expertise of epileptologists. This novel system can identify patients with seizures similar to that of a patient being evaluated, thus optimizing the treatment plan by considering the treatment and the results of treating similar patients in the past, potentially resulting in an improved surgery outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,044

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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