Comparison of MIMIC-III and MIMIC-IV for big data analytics of health informatics
Notice bibliographique
Résumé
The use of a health big data via Medical Information Mart for Intensive Care (MIMIC) data sets has significant advancements in health informatics and clinical research of electronic health records (EHRs) in hospital systems. MIMIC-III and MIMIC-IV data sets are the two latest publicly available iterations of data from electronic records that possess distinct features, variables, and structures in two separate large relational databases. This study aimed to provide big data analytics comparisons of MIMIC-III and MIMIC-IV for experiential learning of health informatics from EHRs.Both data sets were quantitatively and qualitatively evaluated based on dataset properties (data, list of tables, timeline, patient encounters, software, system), data mining and visual categories (i.e., data size, data structure and schema, features/variables, data quality and completeness, clinical focus, access and use, dashboards, and visualization types), data usability heuristics and utilization (i.e., usability, complexity, granularity, applicability, and capacity). Results showed significant difference of 100 patients across 26 tables for MIMIC-III compared to 2,520 patients across 31 tables for MIMIC-IV data sets, respectively. There were 1716 diagnoses (ICD-9) and 503 procedures (ICD-9) for MIMIC-III. There were 262 diseases categories with >1000 disease instances and >2000 treatments for MIMIC-IV with no ICD codes. Moreover, these data sets contained large (big data) charting events in MIMIC-III of 758,356 rows, and MIMIC-IV eICU with charting events of 1,477,163 for nursing, and respiratory of 176,089 rows, respectively. The results suggest that MIMIC-III provided detailed information for retrospective clinical studies and operations in critical care with high data granularity in terms of re-admission (calculated fields from its admission table), length of stay, prescriptions, caregivers, and diagnosis and procedure (ICD-9). However, it lacked clinical capacity because of no diagnosis or charting event offset times or APACHE IV (Acute Physiology and Chronic Health Evaluation) scores that were in the MIMIC-IV eICU dataset. Hence, MIMIC-IV showed higher data granularity and capacity. MIMIC-IV eICU dataset introduces enhanced data attributes, more sophisticated patient trajectory tracking at the ICU unit level, and improved detailed information from electronic records. Moreover, MIMIC-IV has high usability, complexity, and applicability to critical care but lacking hospital operational data of re-admissions, caregivers, and ICD codes that MIMIC-III contained. However, MIMIC-IV dataset contained complex data schemas of treatment strings, nurse care plans, lab results, medications, microbiology, as well as infusion drug and respiratory charting. The big data analytics of MIMIC-III and MIMIC-IV needs to be further investigated for AI applications to demonstrate its usefulness for dynamic decision-making in health care.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,038 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,004 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».