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Enregistrement W4391109772 · doi:10.1017/s0950268824000037

The predictive role of symptoms in COVID-19 diagnostic models: A longitudinal insight

2024· article· en· W4391109772 sur OpenAlexafffund
Olivia Bird, Eva Galiza, D. N. Baxter, Marta Boffito, Duncan L. Browne, Fiona Burns, David Chadwick, Rebecca A. Clark, Catherine A. Cosgrove, James Galloway, Anna L. Goodman, Amardeep Heer, Andrew Higham, Shalini Iyengar, Christopher Jeanes, Philip A. Kalra, Christina Kyriakidou, Judy Bradley, Chigomezgo Munthali, Angela M. Minassian, Fiona McGill, Patrick Moore, Imrozia Munsoor, Helen Nicholls, Orod Osanlou, Jonathan Packham, Carol Pretswell, Alberto San Francisco Ramos, Dinesh Saralaya, Ray Sheridan, Richard Smith, Roy L. Soiza, Pauline A. Swift, Emma C. Thomson, Jeremy Turner, Marianne Elizabeth Viljoen, Paul T. Heath, Irina Chis Ster

Notice bibliographique

RevueEpidemiology and Infection · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesSt George's University Hospitals NHS Foundation TrustOxford University Hospitals NHS Foundation TrustNewcastle UniversityUniversity of OxfordUniversity of ExeterNational Institute for Health and Care ResearchQueen's UniversityNovavaxUniversity Hospital Southampton NHS Foundation TrustQueen's University BelfastUniversity College LondonAstraZenecaModernaPfizer
Mots-clésAnosmiaMedicinePopulationCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Viral sheddingSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VaccinationSeverity of illnessDiseaseInternal medicineImmunologyVirusInfectious disease (medical specialty)Environmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To investigate the symptoms of SARS-CoV-2 infection, their dynamics and their discriminatory power for the disease using longitudinally, prospectively collected information reported at the time of their occurrence. We have analysed data from a large phase 3 clinical UK COVID-19 vaccine trial. The alpha variant was the predominant strain. Participants were assessed for SARS-CoV-2 infection via nasal/throat PCR at recruitment, vaccination appointments, and when symptomatic. Statistical techniques were implemented to infer estimates representative of the UK population, accounting for multiple symptomatic episodes associated with one individual. An optimal diagnostic model for SARS-CoV-2 infection was derived. The 4-month prevalence of SARS-CoV-2 was 2.1%; increasing to 19.4% (16.0%-22.7%) in participants reporting loss of appetite and 31.9% (27.1%-36.8%) in those with anosmia/ageusia. The model identified anosmia and/or ageusia, fever, congestion, and cough to be significantly associated with SARS-CoV-2 infection. Symptoms' dynamics were vastly different in the two groups; after a slow start peaking later and lasting longer in PCR+ participants, whilst exhibiting a consistent decline in PCR- participants, with, on average, fewer than 3 days of symptoms reported. Anosmia/ageusia peaked late in confirmed SARS-CoV-2 infection (day 12), indicating a low discrimination power for early disease diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,273
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,145
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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