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Enregistrement W4391113254 · doi:10.1136/bmjopen-2023-073455

Predicting incident heart failure from population-based nationwide electronic health records: protocol for a model development and validation study

2024· article· en· W4391113254 sur OpenAlexaff
Yoko M. Nakao, Ramesh Nadarajah, Farag Shuweihdi, Kazuhiro Nakao, Ahmet Fuat, Jim Moore, Chris Bates, Jianhua Wu, Chris P Gale

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensBishop's University
Organismes subventionnairesBritish Heart Foundation
Mots-clésMedicineProtocol (science)EpidemiologyHealth recordsElectronic health recordPublic healthPopulationHeart failureMedical emergencyEnvironmental healthAlternative medicineHealth careInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Heart failure (HF) is increasingly common and associated with excess morbidity, mortality, and healthcare costs. Treatment of HF can alter the disease trajectory and reduce clinical events in HF. However, many cases of HF remain undetected until presentation with more advanced symptoms, often requiring hospitalisation. Predicting incident HF is challenging and statistical models are limited by performance and scalability in routine clinical practice. An HF prediction model implementable in nationwide electronic health records (EHRs) could enable targeted diagnostics to enable earlier identification of HF. METHODS AND ANALYSIS: We will investigate a range of development techniques (including logistic regression and supervised machine learning methods) on routinely collected primary care EHRs to predict risk of new-onset HF over 1, 5 and 10 years prediction horizons. The Clinical Practice Research Datalink (CPRD)-GOLD dataset will be used for derivation (training and testing) and the CPRD-AURUM dataset for external validation. Both comprise large cohorts of patients, representative of the population of England in terms of age, sex and ethnicity. Primary care records are linked at patient level to secondary care and mortality data. The performance of the prediction model will be assessed by discrimination, calibration and clinical utility. We will only use variables routinely accessible in primary care. ETHICS AND DISSEMINATION: Permissions for CPRD-GOLD and CPRD-AURUM datasets were obtained from CPRD (ref no: 21_000324). The CPRD ethical approval committee approved the study. The results will be submitted as a research paper for publication to a peer-reviewed journal and presented at peer-reviewed conferences. TRIAL REGISTRATION DETAILS: The study was registered on Clinical Trials.gov (NCT05756127). A systematic review for the project was registered on PROSPERO (registration number: CRD42022380892).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,067
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,079
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,355

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0670,079
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0830,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,364 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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